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2021 年度 実績報告書

タンパク質熱変性状態の検出に立脚した生物活性物質の標的同定法

研究課題

研究課題/領域番号 19H02848
研究機関東北大学

研究代表者

佐藤 伸一  東北大学, 学際科学フロンティア研究所, 助教 (20633134)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2023-03-31
キーワードチロシン残基 / ヒスチジン残基 / タンパク質ラベル化 / 標的同定 / 熱変性
研究実績の概要

タンパク質の変性を検出する手法や、変性度を定量する手法を開発することを目指した。タンパク質の熱変性を検出手法は、生物活性物質の標的タンパク質同定に貢献し、その作用メカニズムを明らかにする目的で有用な手法となる。
非変性時においては、一般的にタンパク質構造中の疎水性構造はタンパク質内部構造に埋もれているが、熱変性過程において、タンパク質の表面に露出することが知られている。我々はタンパク質の疎水性アミノ酸残基の一つであるチロシン残基に着目し、これまで研究を行ってきた。我々の開発したチロシン残基特異的ラベル化反応はタンパク質表面に露出したチロシン残基上で選択的に起きるため、タンパク質の熱変性度を高精度に可視化できる手法になると考えた。従来のチロシン残基修飾剤は試薬を添加した瞬間に反応が完結するものの、水中で求電子性の分解物が生じるため、チロシン残基以外のアミノ酸残基を修飾してしまう副反応が問題であった。そこで、ウラゾール骨格の化合物の誘導化とペプチドを用いた評価実験を通じて、本研究目的に適したチロシン残基修飾剤を見出すことに成功した。
また、昨年度の本研究の副次的な成果によって、タンパク質のヒスチジン残基を修飾する手法の開発に成功した。チロシン残基、ヒスチジン残基修飾法のそれぞれの反応条件を検討し、反応効率の向上、実験操作簡便性の向上に成功した。それぞれの芳香族アミノ酸残基修飾法について、被標識残基をタンパク質部位レベルで解析し、タンパク質表面への残基露出度との相関性が示唆される結果を得た。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

タンパク質の熱変性過程においてタンパク質の特定残基を標識するという目的を達成するためには、変性時に露出した残基を瞬時に修飾する必要がある。試薬を添加するだけで、迅速に修飾反応が完結するチロシン残基修飾剤の開発に取り組み、成功した。従来のチロシン残基修飾剤は試薬を添加した瞬間に反応が完結するものの、水中で求電子性の分解物が生じるため、チロシン残基以外のアミノ酸残基を修飾してしまう副反応が問題であった。そこで、ウラゾール骨格の化合物の誘導化とペプチドを用いた評価実験を通じて、本研究目的に適したチロシン残基修飾剤を見出すことに成功した。本年度では、従来法との反応性の比較を行い、高いチロシン残基選択性でタンパク質を効率的に標識できることを証明した。また、細胞破砕液のような複雑なタンパク質混在系においても、本手法が適用できることを示した。
さらに、本研究により見出されたヒスチジン残基修飾法の改良に取り組んだ。ヒスチジン残基の効率的修飾法は世界的に報告例が少なく、タンパク質化学修飾研究に大きく役立つ成果となる。一重項酸素を産生する光触媒の適用範囲を拡張することができた。生体関連化学研究で蛍光分子として汎用されているBODIPYを触媒として活用できることを見出した。本成果は、これまで蛍光プローブとして用いていたBODIPY結合プローブを蛍光プローブとしてだけなく、近接標識の触媒分子としても利用できる可能性を示唆している。

今後の研究の推進方策

2022年度開始までに、タンパク質のチロシン残基および、ヒスチジン残基を効率的に修飾する手法を開発している。また、タンパク質の標識部位を同定しつつ、定量解析可能なプロテオミクス専用の質量分析装置を2021年度中にセットアップした。また、タンパク質の修飾部位解析の実験手法を確立した。そこで、2022年度では、本実験装置/手法を活用し、タンパク質修飾反応を最適化する。また、それを用いて、細胞破砕液などの複雑なタンパク質混合物中でタンパク質修飾反応を行い、修飾されたタンパク質のプロファイリングを行う。
特に、本年度開始までに見出したチロシン残基修飾反応は、従来の手法よりも効率的であることが示唆されている。チロシン残基はタンパク質の熱変性過程においてタンパク質表面に露出するという特徴を有しているだけでなく、リン酸化シグナル、タンパク質間相互作用の結合界面への寄与も大きいアミノ酸残基である。そこで、これらの生命現象解明のためのツールとして、本チロシン残基修飾反応を活用し、得られる成果を原著論文にまとめ上げる。
具体的な実験手法としては、独自のチロシン残基修飾法がタンパク質混合物中のどのような部位のチロシン残基を標識しているのかという事を調べるため、デスチオビオチン共役型の修飾剤で標識し、標識されたタンパク質/ペプチド断片を濃縮する。濃縮されたサンプルをプロテオミクス専用の質量分析装置で解析し、修飾タンパク質/部位をプロファイリングする。
ヒスチジン残基修飾法に関しては、より汎用性の高い手法への発展を目指した展開を進める。磁性ビーズ表面に生物活性分子を機能化したアフィニティービーズ上の空間を反応場として、生物活性分子に結合するリガンドを網羅的に解析するシステムを構築する。そのために、ヒスチジン残基修飾反応の触媒となる分子の最適化、ビーズへの機能化方法について検討する。

  • 研究成果

    (31件)

すべて 2022 2021 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (25件) (うち国際学会 4件、 招待講演 9件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] BODIPY Catalyzes Proximity‐Dependent Histidine Labelling2022

    • 著者名/発表者名
      Nakane Keita、Niwa Tatsuya、Tsushima Michihiko、Tomoshige Shusuke、Taguchi Hideki、Nakamura Hiroyuki、Ishikawa Minoru、Sato Shinichi
    • 雑誌名

      ChemCatChem

      巻: 14 ページ: e202200077

    • DOI

      10.1002/cctc.202200077

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Intracellular photocatalytic-proximity labeling for profiling protein-protein interactions in microenvironments2022

    • 著者名/発表者名
      Tsushima Michihiko、Sato Shinichi、Miura Kazuki、Niwa Tatsuya、Taguchi Hideki、Nakamura Hiroyuki
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 58 ページ: 1926~1929

    • DOI

      10.1039/d1cc05764b

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Proximity Histidine Labeling by Umpolung Strategy Using Singlet Oxygen2021

    • 著者名/発表者名
      Nakane Keita、Sato Shinichi、Niwa Tatsuya、Tsushima Michihiko、Tomoshige Shusuke、Taguchi Hideki、Ishikawa Minoru、Nakamura Hiroyuki
    • 雑誌名

      Journal of the American Chemical Society

      巻: 143 ページ: 7726~7731

    • DOI

      10.1021/jacs.1c01626

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Functionalization of Human Serum Albumin by Tyrosine Click2021

    • 著者名/発表者名
      Obara Satsuki、Nakane Keita、Fujimura Chizu、Tomoshige Shusuke、Ishikawa Minoru、Sato Shinichi
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 22 ページ: 8676~8676

    • DOI

      10.3390/ijms22168676

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Preparation of an antigen-responsive fluorogenic immunosensor by tyrosine chemical modification of the antibody complementarity determining region2021

    • 著者名/発表者名
      Sato Shinichi、Matsumura Masaki、Ueda Hiroshi、Nakamura Hiroyuki
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 57 ページ: 9760~9763

    • DOI

      10.1039/d1cc03231c

    • 査読あり
  • [学会発表] Tyrosine Labeling and Preparation of Antigen-Responsive Fluorogenic Immunosensor2022

    • 著者名/発表者名
      Shinichi Sato
    • 学会等名
      Korea-Japan Joint Workshop on Biofunctional Chemistry
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Intracellular photocatalytic-proximity labeling for profiling proteoin-protein interactions2022

    • 著者名/発表者名
      Shinichi Sato
    • 学会等名
      東北大学後期第5回全領域合同研究交流会
  • [学会発表] 酸化酵素laccaseを用いた高効率チロシン残基特異的修飾の開発2022

    • 著者名/発表者名
      中根 啓太, 宮野 翔伍, 友重 秀介, 石川 稔, 佐藤 伸一
    • 学会等名
      日本農芸化学会2022年度大会
  • [学会発表] Selective photo-labelling of G4 DNA-binding protein2022

    • 著者名/発表者名
      Ahmed Mostafa Abdelhady, Kazumitsu Onizuka, Tatsuki Masuzawa, Shinichi Sato, Takanori Oyoshi, Fumi Nagatsugi
    • 学会等名
      日本化学会第102春季年会
  • [学会発表] チロシン残基のグリコシル化を基盤としたAβ凝集抑制手法2022

    • 著者名/発表者名
      樋口 凜, 中根 啓太, 佐藤 伸一, 友重 秀介, 石川 稔
    • 学会等名
      日本薬学会第142年会
  • [学会発表] チロシン残基修飾法によるヒト血清アルブミンの機能化2022

    • 著者名/発表者名
      小原 紗月, 中根 啓太, 藤村 千鶴, 友重 秀介, 石川 稔, 佐藤 伸一
    • 学会等名
      日本薬学会第142年会
  • [学会発表] 酸化酵素laccaseを用いた高効率チロシン残基特異的修飾2022

    • 著者名/発表者名
      中根 啓太, 宮野 翔伍, 友重 秀介, 石川 稔, 佐藤 伸一
    • 学会等名
      日本薬学会第142年会
  • [学会発表] 細胞内タンパク質間相互作用解析のための光触媒近接タンパク質標識法の開発2021

    • 著者名/発表者名
      對馬理彦, 三浦一輝, 佐藤伸一, 丹羽達也, 田口英樹, 中村浩之
    • 学会等名
      日本ケミカルバイオロジー学会 第15回年会
  • [学会発表] 一重項酸素を活用したヒスチジン残基近接標識法の開発2021

    • 著者名/発表者名
      中根啓太, 丹羽達也, 對馬理彦, 田口英樹, 友重秀介, 中村浩之, 石川稔, 佐藤伸一
    • 学会等名
      日本ケミカルバイオロジー学会 第16回年会
  • [学会発表] 色素分子のレドックス特性と光増感特性を活用したタンパク質化学修飾2021

    • 著者名/発表者名
      佐藤伸一
    • 学会等名
      第43回日本光医学・光生物学会 シンポジウム 光機能分子の最前線:光と分子ができること
    • 招待講演
  • [学会発表] 高反応性化学種を使った抗体の化学修飾2021

    • 著者名/発表者名
      佐藤伸一
    • 学会等名
      令和3年度 後期第3回 全領域合同研究交流会
  • [学会発表] 生命科学研究への応用を指向したタンパク質化学修飾反応の開発2021

    • 著者名/発表者名
      佐藤伸一
    • 学会等名
      東北大学生命科学交流ミーティング
    • 招待講演
  • [学会発表] 酸化酵素を用いた高効率チロシン残基修飾反応2021

    • 著者名/発表者名
      中根啓太, 宮野翔伍, 友重秀介, 石川稔, 佐藤伸一
    • 学会等名
      生体機能関連化学部会若手の会 第32回サマースクール
  • [学会発表] 酵素を用いたチロシン残基特異的修飾反応2021

    • 著者名/発表者名
      佐藤伸一, 中根啓太, 宮野翔吾, 友重秀介, 石川稔
    • 学会等名
      第53回ペプチド夏の勉強会
  • [学会発表] 一重項酸素を駆使したヒスチジン残基近接標識法2021

    • 著者名/発表者名
      中根啓太, 丹羽達也, 對馬理彦, 田口英樹, 友重秀介, 中村浩之, 石川稔, 佐藤 伸一
    • 学会等名
      第53回ペプチド夏の勉強会
  • [学会発表] 一重項酸素を活用したヒスチジン残基化学修飾2021

    • 著者名/発表者名
      佐藤伸一, 中根啓太, 丹羽達也, 對馬理彦, 田口英樹, 中村浩之, 友重秀介, 石川稔
    • 学会等名
      第15回バイオ関連化学シンポジウム
  • [学会発表] 酸化酵素 laccaseを用いた高効率チロシン残基特異的修飾2021

    • 著者名/発表者名
      中根啓太, 宮野翔伍, 友重秀介, 石川稔, 佐藤伸一
    • 学会等名
      第15回バイオ関連化学シンポジウム
  • [学会発表] 酸素代謝を活用したタンパク質化学修飾と近接標識への応用2021

    • 著者名/発表者名
      佐藤伸一
    • 学会等名
      第27回医用近赤外線分光法研究会・第25回酸素ダイナミクス研究会 合同研究会
    • 招待講演
  • [学会発表] 有機化学の力でタンパク質を機能化する2021

    • 著者名/発表者名
      佐藤伸一
    • 学会等名
      明治薬科大学 令和3年度 第一回化学系若手研究者講談
    • 招待講演
  • [学会発表] 生理活性ペプチド機能化ツールとしてのチロシン残基化学修飾法の開発2021

    • 著者名/発表者名
      佐藤伸一
    • 学会等名
      第94回日本生化学会大会 シンポジウム「生理活性ペプチドと中分子創薬~新たな創薬ブレイクスルーを目指して」
    • 招待講演
  • [学会発表] Development of proximity labeling via histidine oxidation by singlet oxygen and Fc-selective functionalization of antibody2021

    • 著者名/発表者名
      Keita Nakane, Tatsuya Niwa, Michihiko Tsushima, Hideki Taguchi, ShusukeTomoshige, Hiroyuki Nakamura, Minoru Ishikawa, Shinichi Sato
    • 学会等名
      The 10th Annual Conference of The International Chemical Biology Society
    • 国際学会
  • [学会発表] 核酸結合タンパク質同定のための近接標識法開発2021

    • 著者名/発表者名
      佐藤伸一, 中根啓太, Ahmed Mostafa Abdelhady, 増澤樹, 大吉崇文, 友重秀介, 石川稔, 永次史, 鬼塚和光
    • 学会等名
      第8回東北大学若手研究者アンサンブルワークショップ
  • [学会発表] Site-specific modification of antibody using enzyme-catalyzed tyrosine click2021

    • 著者名/発表者名
      Shinichi Sato
    • 学会等名
      Tohoku University FRIS-Konkuk University Joint Virtual Workshop 2021
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Site-selective antibody fluorescent labeling using single-electron transfer reaction2021

    • 著者名/発表者名
      Shinichi Sato
    • 学会等名
      Pacifichem 2021, Scientific Program of Symposium “Fluorescent Chemical Tools for Exploring Protein Functions through Organic Chemistry”
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 高反応性化学種を活用した抗体の残基・部位選択的武装化2021

    • 著者名/発表者名
      佐藤伸一
    • 学会等名
      星薬科大学-理研-東北大学医薬品開発研究センターシンポジウム 第4回 精密武装抗体の合成と機能評価
    • 招待講演
  • [備考] 佐藤伸一研究グループホームページ

    • URL

      https://www2.fris.tohoku.ac.jp/~sato/

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公開日: 2022-12-28  

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