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2021 年度 実績報告書

静止期Bリンパ球の迅速的活性化の基盤となるエンハンサーアイランド形成機序の解明

研究課題

研究課題/領域番号 19H03210
研究機関大阪大学

研究代表者

二村 圭祐  大阪大学, 大学院医学系研究科, 准教授 (00462713)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
キーワード多因子間相互作用 / DNAバーコード / 転写
研究実績の概要

B細胞は静止期状態でエンハンサー領域の基盤を形成しておくことで、急速な活性化に対応できるように準備し、かつ、静止期状態には遺伝子発現を抑制するためにエンハンサー領域を凝集させエンハンサーアイランドを形成するという仮説をこれまでに得られた予備的な結果からたてている。しかし、このようなエンハンサーアイランドは非常に多くのタンパク質やRNAから形成されていると考えられ、この多因子間で形成される複雑な相互作用を定量的に計測することは現在の技術では困難である。そこで、このエンハンサーアイランドを定量的に測るための次世代シークエンシングを用いた新規な多因子間相互作用解析法を確立することを目指し研究を進めている。実験系はこれまでの研究で用いている方法を用いた。具体的には、4-6週齢マウスの脾臓からB細胞をB cell isolation kitで回収した。活性化は、LPS、IL4を含む培地で行った。LPS添加前、後6時間、24時間、48時間の細胞において、転写を制御する複数因子の間で形成される相互作用を解析する方法の開発を進めた。16種類の抗体にDNAバーコードを付加し、ポリマー中でPCR反応を行った。このデータの解析から、本法で得られるデータはグラフ構造を取ることがわかった。その結果、この新規多因子間相互作用解析法は3000個以下のB細胞から多因子間にわたる相互作用を検出できることがわかった。このことから本法は新規な多因子間相互作用解析法として確立できることが考えられた。

現在までの達成度 (段落)

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (1件) (うち招待講演 1件) 産業財産権 (1件) (うち外国 1件)

  • [雑誌論文] Design and synthesis of ether derivatives of spliceostatin A and their biological evaluation towards prostate cancer treatment2023

    • 著者名/発表者名
      Hirabayashi Satoru、Li Yue、Ohta Noriko、Ishibashi Airi、Yoshikawa Yusuke、Lin Bangzhong、Fumimoto Megumi、Takehara Tsunayoshi、Nunomura Kazuto、Suzuki Takeyuki、Haruta Junichi、Nimura Keisuke、Arisawa Mitsuhiro
    • 雑誌名

      Tetrahedron Letters

      巻: 114 ページ: 154288~154288

    • DOI

      10.1016/j.tetlet.2022.154288

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Pilot study for the treatment of cutaneous neurofibromas in neurofibromatosis type 1 patients using topical sirolimus gel2023

    • 著者名/発表者名
      Wataya-Kaneda Mari、Watanabe Yoshiyuki、Nakamura Ayumi、Yamamoto Kouji、Okada Kiyoshi、Maeda Shinichiro、Nimura Keisuke、Saga Kotaro、Katayama Ichiro
    • 雑誌名

      Journal of the American Academy of Dermatology

      巻: 88 ページ: 877~880

    • DOI

      10.1016/j.jaad.2022.08.066

  • [雑誌論文] Dual function of SF3B2 on chromatin and RNA to regulate transcription in head and neck squamous cell carcinoma2022

    • 著者名/発表者名
      Kitamura Koji、Suzuki Hidefumi、Abe Ryota、Inohara Hidenori、Kaneda Yasufumi、Takahashi Hidehisa、Nimura Keisuke
    • 雑誌名

      Cell & Bioscience

      巻: 12 ページ: 92

    • DOI

      10.1186/s13578-022-00812-8

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] DNA barcoding and gene expression recording reveal the presence of cancer cells with unique properties during tumor progression2022

    • 著者名/発表者名
      Umeki Yuka、Ogawa Noriaki、Uegaki Yuko、Saga Kotaro、Kaneda Yasufumi、Nimura Keisuke
    • 雑誌名

      Cellular and Molecular Life Sciences

      巻: 80 ページ: 17

    • DOI

      10.1007/s00018-022-04640-4

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Identification of Malignant Cell Populations Associated with Poor Prognosis in High-Grade Serous Ovarian Cancer Using Single-Cell RNA Sequencing2022

    • 著者名/発表者名
      Sumitani Naoki、Ishida Kyoso、Sawada Kenjiro、Kimura Tadashi、Kaneda Yasufumi、Nimura Keisuke
    • 雑誌名

      Cancers

      巻: 14 ページ: 3580~3580

    • DOI

      10.3390/cancers14153580

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Peroxisomal Membrane Protein PMP34 Is Involved in the Human Papillomavirus Infection Pathway2022

    • 著者名/発表者名
      Ito Rie、Kitamura Koji、Inohara Hidenori、Yusa Kosuke、Kaneda Yasufumi、Nimura Keisuke
    • 雑誌名

      Frontiers in Virology

      巻: 2 ページ: 870922

    • DOI

      10.3389/fviro.2022.870922

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 多因子間相互作用による遺伝子発現制御機構の解明2022

    • 著者名/発表者名
      二村圭祐
    • 学会等名
      日本分子生物学会
    • 招待講演
  • [産業財産権] 生体試料中の多因子間相互作用を同定する方法およびキット2022

    • 発明者名
      二村圭祐
    • 権利者名
      二村圭祐
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      特願2022-068519
    • 外国

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公開日: 2023-12-25  

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