無細胞ヒトプロテインアレイを用いた薬剤依存的相互作用タンパク質同定技術の開発

2021 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 19H03218
• 研究機関: 愛媛大学
• 研究代表者: 澤崎 達也 愛媛大学, プロテオサイエンスセンター, 教授 (50314969)
• 研究期間 (年度): 2019-04-01 – 2022-03-31
• キーワード: サリドマイド / コムギ無細胞タンパク質合成 / 免疫調整剤 / IMiD / 蛋白質分解 / ユビキチン / タンパク質分解誘導剤

研究実績の概要

本研究課題では目的は2つある。サリドマイドとE7820をモデルに、1) ヒト全タンパク質レベルで薬剤依存的に相互作用するタンパク質を同定できる技術の開発、 2) 新しく見出した基質タンパク質の細胞レベル、個体レベルの解析、および構造解析を進め、タンパク質分解誘導薬剤サリドマイド・E7820の薬効作用点の解明である。そこで本年度は、昨年度に行った2万4千種類からなるヒトプロテインアレイを用いた大規模スクリーニングにより見出した薬剤依存的に相互作用するタンパク質の細胞生物学的解析を行った。
様々な培養細胞を用いた解析の結果、IMiDsであるポマリドミド依存的に分解誘導される標的タンパク質としてZMYM2 (zinc finger MYM-type protein 2)を見出し、血液がんを引き起こすZMYM2-FGFR1融合タンパク質も分解誘導されることを明らかにした。研究内容の一部は、Nature Communicationsへ掲載された。
DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-021-27818-z

現在までの達成度 (段落)

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

研究成果

• [雑誌論文] A proximity biotinylation-based approach to identify protein-E3 ligase interactions induced by PROTACs and molecular glues (2022)
  • 著者名/発表者名: Yamanaka Satoshi、Horiuchi Yuto、Matsuoka Saya、Kido Kohki、Nishino Kohei、Maeno Mayaka、Shibata Norio、Kosako Hidetaka、Sawasaki Tatsuya
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 13 ページ: 183
  • DOI: 10.1038/s41467-021-27818-z
• [雑誌論文] A simple method for labeling proteins and antibodies with biotin using the proximity biotinylation enzyme TurboID (2022)
  • 著者名/発表者名: Shioya Ryouhei、Yamada Kohdai、Kido Kohki、Takahashi Hirotaka、Nozawa Akira、Kosako Hidetaka、Sawasaki Tatsuya
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 592 ページ: 54～59
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2021.12.109
• [雑誌論文] Immune gene activation by NPR and TGA transcriptional regulators in the model monocot Brachypodium distachyon. (2022)
  • 著者名/発表者名: Shimizu Kohei、Suzuki Hitomi、Uemura Takuya、Nozawa Akira、Desaki Yoshitake、Hoshino Ryosuke、Yoshida Ayako、Abe Hiroshi、Nishiyama Makoto、Nishiyama Chiharu、Sawasaki Tatsuya、Arimura Gen‐ichiro
  • 雑誌名: The Plant Journal 巻: 110 ページ: 470～481
  • DOI: 10.1111/tpj.15681
• [雑誌論文] Protein?protein interactions between jasmonate-related master regulator MYC and transcriptional mediator MED25 depend on a short binding domain (2022)
  • 著者名/発表者名: Takaoka Yousuke、Suzuki Kaho、Nozawa Akira、Takahashi Hirotaka、Sawasaki Tatsuya、Ueda Minoru
  • 雑誌名: Journal of Biological Chemistry 巻: 298 ページ: 101504～101504
  • DOI: 10.1016/j.jbc.2021.101504
• [雑誌論文] AGIA Tag System for Ultrastructural Protein Localization Analysis in Blood-Stage Plasmodium falciparum (2021)
  • 著者名/発表者名: Morita Masayuki、Kanoi Bernard N.、Shinzawa Naoaki、Kubota Rie、Takeda Hiroyuki、Sawasaki Tatsuya、Tsuboi Takafumi、Takashima Eizo
  • 雑誌名: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology 巻: 11 ページ: 777291
  • DOI: 10.3389/fcimb.2021.777291
• [雑誌論文] Cleavage of TANK-Binding Kinase 1 by HIV-1 Protease Triggers Viral Innate Immune Evasion (2021)
  • 著者名/発表者名: Jeremiah Sundararaj Stanleyraj、Miyakawa Kei、Matsunaga Satoko、Nishi Mayuko、Kudoh Ayumi、Takaoka Akinori、Sawasaki Tatsuya、Ryo Akihide
  • 雑誌名: Frontiers in Microbiology 巻: 12 ページ: 643407
  • DOI: 10.3389/fmicb.2021.643407
• [雑誌論文] 近位依存性ビオチン化酵素によるタンパク質相互作用解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 澤崎 達也
  • 雑誌名: 日本プロテオーム学会誌 巻: 6 ページ: 9～16
  • DOI: 10.14889/jpros.6.1_9
• [学会発表] 新規近接ビオチン化酵素AirIDを用いたタンパク質分解誘導剤依存的なインタラクトーム解析技術の開発 (2021)
  • 著者名/発表者名: 山中 聡士、堀内 雄斗、西野 耕平、小迫 英尊、澤崎 達也
  • 学会等名: 第94回日本生化学会大会
• [学会発表] 新規ビオチン化酵素AirIDを用いた細胞内分子のり型薬剤依存的な相互作用タンパク質を解析する技術の開発 (2021)
  • 著者名/発表者名: 堀内雄斗、山中聡士、城戸康希、西野耕平、小迫英尊、澤崎達也
  • 学会等名: 第44回日本分子生物学会年会
• [学会発表] タンパク質分解誘導分子探索・解析のためのDCAFプロテインアレイとAirID融合DCAFファミリー細胞ライブラリー (2021)
  • 著者名/発表者名: 庄屋 祐希、 三輪 和慶、 城戸 康希、山中 聡士、 澤崎 達也
  • 学会等名: 第44回日本分子生物学会年会
• [学会発表] mAbID and FabID: Antibody dependent proximity biotinylation technology using AirID for cell-surface protein-protein interactome analysis of membrane proteins (2021)
  • 著者名/発表者名: Kohdai Yamada, Ryohei Shioya, Soh Tokunaga, Fumiya Soga, Kohki Kido, Mika K Kaneko, Yukinari Kato, Tatsuya Sawasaki
  • 学会等名: 第44回日本分子生物学会年会
• [学会発表] インターフェロン誘導性因子IFI27の抗フラビウイルス活性の分子機構 (2021)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 陽一、坂口 翔、高橋 宏隆、川島 生、江見 晶野、加藤 文博、日紫喜 隆行、呉紅、田島 茂、林 昌宏、高崎 智彦、澤崎 達也、中野 隆史
  • 学会等名: 第55回日本脳炎ウイルス生態学研究会
• [学会発表] A novel LUBAC-associated protein plays important roles in inflammatory response through regulation of programmed cell death. (2021)
  • 著者名/発表者名: Linh T.T. Tran、清水康平、及川大輔、小迫英尊、高橋宏隆、澤崎達也、徳永文稔
  • 学会等名: 第94回日本生化学会大会
• [備考] 澤崎研究室HP
  • URL: http://www.pros.ehime-u.ac.jp/cell-free/index.html