| 研究課題/領域番号 |
19H03424
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 審査区分 |
小区分48040:医化学関連
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| 研究機関 | 京都大学 (2020-2021)
九州大学 (2019) |
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研究代表者 |
沖 真弥 京都大学, 医学研究科, 特定准教授 (90452713)
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| 研究分担者 |
大川 恭行 九州大学, 生体防御医学研究所, 教授 (80448430)
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| 研究期間 (年度) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| キーワード | 空間オミクス |
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| 研究成果の概要 |
組織特異的な遺伝子発現やエピゲノミクス解析においては、個体や臓器から特定の細胞集団を高い純度で「分取」しなければならない。しかしlaser microdissection法では微小な細胞集団の分離は難しく、cell sortingでは酵素処理で細胞懸濁するさいのダメージは避けられない。本研究はそのような「分取」とは異なる、まったく新たな手法、Photo-Isolation Chemistryを開発し、光照射領域に限定したトランスクリプトーム解析に成功した。
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| 自由記述の分野 |
空間オミクス
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
ROIに対するUV照射の分解能は、光学限界のサブミクロンオーダーまで高められる。したがって１細胞レベルのROIに照射できるうえ、特定のオルガネラに局在する転写産物も分離できる。本手法は、caged オリゴDNAさえあればだれでも実験できるため、急速に普及することが期待される。また、本研究提案の根幹技術はATAC-seqやChIL-seqにも適用できると考えられるため、将来、組織特異的なエピゲノミクスデータを取得できると期待される。
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