| 研究課題/領域番号 |
19H03425
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| 研究機関 | 国際医療福祉大学 |
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研究代表者 |
辻 省次 国際医療福祉大学, 医学部, 教授 (70150612)
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| 研究分担者 |
池内 健 新潟大学, 脳研究所, 教授 (20372469)
田中 真生 国際医療福祉大学, 医学部, 講師 (30774252)
石浦 浩之 東京大学, 医学部附属病院, 講師 (40632849)
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| 研究期間 (年度) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| キーワード | アルツハイマー病 / rare variants / association study |
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| 研究実績の概要 |
疾患発症に関わる遺伝子の探索は，単一遺伝子疾患に対しては，家系の連鎖解析から出発するpositional cloningが，多因子疾患に対してはゲノムワイド関連解析 (genome-wide association study, GWAS)が行われる．エクソン上には，非同義置換に限定しても，膨大な数の変異が存在する．関連解析では，個々の変異毎に，疾患群と対照群の間で検定を行うが，変異の数に対応した多重検定の補正が必要になり，有意水準としてのp値が極めて小さくなり，検出力を確保するために，巨大なサンプルサイズが必要となる．この課題を克服するために，permutation testingにより，有意水準としてのp値を定めることにより，検出力を高めることを目指した．本研究では， exome解析が完了している孤発性アルツハイマー病患者446例，認知機能正常な高齢健常者446例のexome解析データを用いて，permutation testingによりアルツハイマー病に関連する可能性があると評価される遺伝子を見出した．この遺伝子は，pseudogeneが存在すること，GC率が高い領域が含まれていることから，精度の高いexome解析が必要であることが判明し，exon capture，library作成の最適化を行い，新規に，孤発性アルツハイマー病患者262例，認知機能正常な高齢健常者260例を用いてexome解析を実施し，想定された通りの精度の高いデータを得た．このデータを用いて，permutation testingに基づくp値を定め，関連解析を実施した．当初見出していた候補遺伝子については有意な関連は確認されなかったが，関連が示唆される複数の遺伝子が示された．本研究では，permutation testing により，小さいサンプルサイズであっても検出力を確保できることを示した．
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| 現在までの達成度 (段落) |
令和3年度が最終年度であるため、記入しない。
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| 今後の研究の推進方策 |
令和3年度が最終年度であるため、記入しない。
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