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2020 年度 実績報告書

遺伝学とケミカルバイオロジーの融合による植物オートファジーの分子理解と応用展開

研究課題

研究課題/領域番号 19J01681
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

中村 咲耶  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 特別研究員(PD)

研究期間 (年度) 2019-04-25 – 2022-03-31
キーワードオートファジー / 光障害 / クロロファジー / 葉緑体 / シロイヌナズナ
研究実績の概要

代表者らはこれまでに、太陽光に含まれる紫外線や強度の強い可視光 (強光) によって障害を受けた葉緑体が、丸ごと液胞内へとオートファジー依存的に輸送・除去される「選択的クロロファジー」経路の存在を示した。本研究では、特に障害葉緑体を選び取って認識するレセプター機構に関わる遺伝子群を明らかにし、上記経路の分子レベルでの解明を進めるために、植物遺伝学のアプローチを用いる実験1 と、ケミカルバイオロジーを取り入れる実験2 (ケミカルスクリーニング) を行い、得られた結果に応じてクロロファジー特異的欠損変異株の原因遺伝子およびクロロファジー誘導抑制化合物の作用機序を解析する実験3を進めてきた。
令和2年度は、実験1である、変異原処理を行ったモデル植物シロイヌナズナ個体群からのクロロファジー特異的抑制株の順遺伝学スクリーニングを完了した。そして得られた変異株の原因遺伝子の絞り込みを順次進めた。原因遺伝子である可能性が高いと判断した遺伝子については、蛍光タンパク質融合コンストラクトを作出、シロイヌナズナに導入することで、その細胞内局在評価を行った。またその機能解析を行うためのさらなる実験材料(T-DNA挿入変異株や、CRISPR/Cas9によるゲノム変種株)の作成を進めた。また実験2についても、クロロファジーを抑制する化合物のスクリーニングを行い、複数の候補化合物を得ることに成功した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

順遺伝学スクリーニングおよびケミカルスクリーニングは、一定数の植物体数、化合物数の評価を完了しており、実際にクロロファジーのみを欠損する変異株あるいは抑制する化合物をそれぞれ複数獲得することに成功した。また、得られた候補株、候補化合物の解析を随時進めており、本研究計画はおおむね順調に進行していると考えられる。

今後の研究の推進方策

本計画はおおむね順調に進展しており、大きな計画変更は行わずにすすめていく。注意点としては、ケミカルスクリーニングにおいて想定よりも多くの候補化合物が得られたため、化合物の構造、作用機序を検討しながら、濃度依存活性試験やオートファゴソームマーカーであるATG8を可視化した系統を用いた解析を併せて行うことで、さらに絞り込みを行う。

  • 研究成果

    (9件)

すべて 2021 2020

すべて 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 1件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (2件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Mitophagy in plants2021

    • 著者名/発表者名
      Nakamura Sakuya、Hagihara Shinya、Izumi Masanori
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects

      巻: 1865 ページ: 129916~129916

    • DOI

      10.1016/j.bbagen.2021.129916

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 葉緑体オートファジーの研究展開:植物を超えた議論の発展を目指して2021

    • 著者名/発表者名
      中村咲耶、泉正範
    • 雑誌名

      BSJ-Review

      巻: 12A ページ: 68~77

    • DOI

      10.24480/bsj-review.12a8.00201

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Autophagy Contributes to the Quality Control of Leaf Mitochondria2020

    • 著者名/発表者名
      Nakamura Sakuya、Hagihara Shinya、Otomo Kohei、Ishida Hiroyuki、Hidema Jun、Nemoto Tomomi、Izumi Masanori
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 62 ページ: 229~247

    • DOI

      10.1093/pcp/pcaa162

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] RCB-mediated chlorophagy caused by oversupply of nitrogen suppresses phosphate-starvation stress in plants2020

    • 著者名/発表者名
      Yoshitake Yushi、Nakamura Sakuya、Shinozaki Daiki、Izumi Masanori、Yoshimoto Kohki、Ohta Hiroyuki、Shimojima Mie
    • 雑誌名

      Plant Physiology

      巻: 185 ページ: 318~330

    • DOI

      10.1093/plphys/kiaa030

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Chlorophagy does not require PLANT U-BOX4-mediated ubiquitination2020

    • 著者名/発表者名
      Nakamura Sakuya、Izumi Masanori
    • 雑誌名

      Plant Signaling & Behavior

      巻: 16 ページ: 1861769~1861769

    • DOI

      10.1080/15592324.2020.1861769

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Chloroplast Autophagy and Ubiquitination Combine to Manage Oxidative Damage and Starvation Responses2020

    • 著者名/発表者名
      Kikuchi Yuta、Nakamura Sakuya、Woodson Jesse D.、Ishida Hiroyuki、Ling Qihua、Hidema Jun、Jarvis R. Paul、Hagihara Shinya、Izumi Masanori
    • 雑誌名

      Plant Physiology

      巻: 183 ページ: 1531~1544

    • DOI

      10.1104/pp.20.00237

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Development of potent inhibitors for strigolactone receptor DWARF 142020

    • 著者名/発表者名
      Yoshimura Masahiko、Kim Sojung F.、Takise Ryosuke、Kusano Shuhei、Nakamura Sakuya、Izumi Masanori、Yagi Akiko、Itami Kenichiro、Hagihara Shinya
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 56 ページ: 14917~14919

    • DOI

      10.1039/D0CC01989E

    • 査読あり
  • [学会発表] Plant mitophagy contributes to the maintenance of mitochondrial population and quality in Arabidopsis leaves2021

    • 著者名/発表者名
      中村咲耶、泉正範
    • 学会等名
      第62回 日本植物生理学会年会
  • [学会発表] 葉緑体の分解経路から理解する二重膜オルガネラの普遍的な形態制御機構2020

    • 著者名/発表者名
      泉正範、中村咲耶
    • 学会等名
      日本植物学会
    • 招待講演

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公開日: 2021-12-27  

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