HIV-1感染における内因性免疫と獲得免疫の相反原理の解明

2021 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 19J20488
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 木村 出海 東京大学, 新領域創成科学研究科, 特別研究員(DC1)
• 研究期間 (年度): 2019-04-25 – 2022-03-31
• キーワード: HIV / 内因性免疫 / 獲得免疫 / APOBEC3

研究実績の概要

本研究の目的は、「HLA-B35拘束性のCTL応答から逃避することで生じたE76K変異体は、APOBEC3Fによってもたらされる変異によって多様化し、病態進行を亢進する。これが、HLA-B35がHIV-1感染に対するリスクファクターとなる原因のひとつである」という仮説を検証することである。本検証により、HIV-1感染者それぞれが示す病態進行と予後になぜ個人差が生じるのか、その分子メカニズムの一端の解明へとつながることが期待される。この目的を達成するために、昨年度は、初年度に構築したIn vitro実験系に必要な材料を用いて、実際に変異ウイルスを取得するためのIn vitro感染実験を行なった。具体的には、ウイルスの感染が完全に阻害されることなく、細胞の増殖速度とウイルス感染による細胞死の速度が平衡状態を保つような一定の薬剤濃度でウイルス感染細胞を長期間培養する手法、培養期間とともに徐々に薬剤の濃度を上げていく手法、ウイルスプラスミドとAPOBEC3F発現ベクターを細胞に一過性にco-transfectionし、上清中に放出されたAPOBEC3F結合ウイルスを回収、そのウイルスを新しい細胞にsingle round infectionさせ、放出されたウイルスを回収することで、APOBEC3Fによる過剰な変異挿入を防ぐ実験系といった複数の実験系を用いて変異ウイルスの取得を試みた。しかし、変異ウイルスの取得には至らなかった。

現在までの達成度 (段落)

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

研究成果

• [雑誌論文] The SARS-CoV-2 Lambda variant exhibits enhanced infectivity and immune resistance (2022)
  • 著者名/発表者名: Kimura I, Kosugi Y, Wu J, Zahradnik J, Yamasoba D, Butlertanaka E P, Tanaka Y L, Uriu K, Liu Y, Morizako N, Shirakawa K, Kazuma Y, Nomura R, Horisawa Y, Tokunaga K, Ueno T, Takaori-Kondo A, Schreiber G, Arase H, Motozono C, Saito A, Nakagawa S, Sato K.
  • 雑誌名: Cell Reports 巻: 38 ページ: 110218～110218
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2021.110218
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Altered TMPRSS2 usage by SARS-CoV-2 Omicron impacts infectivity and fusogenicity (2022)
  • 著者名/発表者名: Meng B, Abdullahi A, Ferreira IATM, Goonawardane N, Saito A, Kimura I, Yamasoba D, et al.
  • 雑誌名: Nature 巻: 603 ページ: 706～714
  • DOI: 10.1038/s41586-022-04474-x
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Attenuated fusogenicity and pathogenicity of SARS-CoV-2 Omicron variant (2022)
  • 著者名/発表者名: Suzuki R, Yamasoba D, Kimura I, Wang L, Kishimoto M, Ito J, Morioka Y, Nao N, Nasser H, Uriu K, Kosugi Y, Tsuda M, Orba Y, Sasaki M, Shimizu R, Kawabata R, Yoshimatsu K, Asakura H, Nagashima M, Sadamasu K, Yoshimura K, Sawa H, Ikeda T, Irie T, Matsuno K, Tanaka S, Fukuhara T, Sato K.
  • 雑誌名: Nature 巻: 603 ページ: 700～705
  • DOI: 10.1038/s41586-022-04462-1
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] SARS-CoV-2 spike L452R variant evades cellular immunity and increases infectivity (2021)
  • 著者名/発表者名: Motozono C, Toyoda M, Zahradnik J, Saito A, Nasser H, Tan T S, Ngare I, Kimura I, Uriu K, Kosugi Y, Yue Y, Shimizu R, Ito J, Torii S, Yonekawa A, Shimono N, Nagasaki Y, Minami R, Toya T, Sekiya N, Fukuhara T, Matsuura Y, Schreiber G, Ikeda T, Nakagawa S, Ueno T, Sato K.
  • 雑誌名: Cell Host & Microbe 巻: 29 ページ: 1124～1136.e11
  • DOI: 10.1016/j.chom.2021.06.006
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] SARS-CoV-2 B.1.617 Mutations L452R and E484Q Are Not Synergistic for Antibody Evasion (2021)
  • 著者名/発表者名: Ferreira Isabella A T M、Kemp Steven A、Datir Rawlings、Saito Akatsuki、Meng Bo、Rakshit Partha、Takaori-Kondo Akifumi、Kosugi Yusuke、Uriu Keiya、Kimura Izumi、Shirakawa Kotaro、Abdullahi Adam、Agarwal Anurag、Ozono Seiya、Tokunaga Kenzo、Sato Kei、Gupta Ravindra K.
  • 雑誌名: The Journal of Infectious Diseases 巻: 224 ページ: 989～994
  • DOI: 10.1093/infdis/jiab368
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Neutralization of the SARS-CoV-2 Mu Variant by Convalescent and Vaccine Serum (2021)
  • 著者名/発表者名: Uriu Keiya、Kimura Izumi、Shirakawa Kotaro、Takaori-Kondo Akifumi、Nakada Taka-aki、Kaneda Atsushi、Nakagawa So、Sato Kei
  • 雑誌名: New England Journal of Medicine 巻: 385 ページ: 2397～2399
  • DOI: 10.1056/NEJMc2114706
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Enhanced fusogenicity and pathogenicity of SARS-CoV-2 Delta P681R mutation (2021)
  • 著者名/発表者名: Saito A, Irie T, Suzuki R, Maemura T, Nasser H, Uriu K, Kosugi Y, et al.
  • 雑誌名: Nature 巻: 602 ページ: 300～306
  • DOI: 10.1038/s41586-021-04266-9
  • 査読あり / オープンアクセス