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2021 年度 実績報告書

R1EN融合タンパク質結晶化法の高分子量タンパク質への応用

研究課題

研究課題/領域番号 19K05696
研究機関国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構

研究代表者

真板 宣夫  国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 量子生命科学研究所, 上席研究員 (00404046)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
キーワード構造生物学 / 多孔性配位高分子
研究実績の概要

前年度では三回対称軸上でジスルフィド結合をさせる変異体L137C/V146Cを作って結晶化を試みたが、結晶は得られなかった。当該年度は結晶化条件を再考し、再現性は低いものの、WTについては結晶が得られるようになった。R1ENの2D結晶の作製を目指して、R1ENの二回対称軸と三回対称軸両方にシステイン残基を入れた変異体(A73C/L137C/V146C)を新たに作成して、結晶化を試みた。変異体はWTと比べて発現量と結晶化の再現性が低く、難航したがデータ取得可能な大きさの結晶を得ることが出来た。放射光施設(PhotonFactory)で回折データを取得し電子密度を計算したが、L137C/V146Cは架橋されておらず、変異も入っていないように見えた。コンストラクトの配列を再確認して、配列に間違いがなかったが今後原因を明らかにして再度結晶化を試みる予定である。
R1ENwt自体の結晶化の再現性が悪い点を改善するため結晶化条件の最適化を試みた。これまでの結果から結晶化にはpHが極めてセンシティブなパラメータであることが分かっていた。また結晶化条件は酢酸ナトリウムが主成分であり、酢酸の蒸発によって容易に溶液のpHが変化してしまうことから、もっとpH変化に安定な緩衝液に置換することにした。一方で、結晶構造中に酢酸分子が結合しているのがみられているため、酢酸を適当量入れることが必要と考えられた。そのため、トリスバッファーのpH調整する際に塩酸ではなく酢酸でpH7-8の溶液を作って結晶化を試みた。R1ENwtの微結晶によるシーディングでトリスバッファーの条件で細長い結晶が得られたが、外形上は六角柱ではなく、きわめて小さいものであった。この結晶を放射光施設(PhotonFactory)でX線照射し回折データ取得を試みたが、結晶が小さいため空間群を判定するのに十分な回折点が得られなかった。

  • 研究成果

    (3件)

すべて 2022 2021 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Crystal structure of the PX domain of Vps17p from Saccharomyces cerevisiae2022

    • 著者名/発表者名
      Obita Takayuki、Inaka Koji、Kohda Daisuke、Maita Nobuo
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica Section F Structural Biology Communications

      巻: 78 ページ: 210~216

    • DOI

      10.1107/S2053230X22004472

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of inhibitor-bound human MSPL that can activate high pathogenic avian influenza2021

    • 著者名/発表者名
      Ohno Ayako、Maita Nobuo、Tabata Takanori、Nagano Hikaru、Arita Kyohei、Ariyoshi Mariko、Uchida Takayuki、Nakao Reiko、Ulla Anayt、Sugiura Kosuke、Kishimoto Koji、Teshima-Kondo Shigetada、Okumura Yuushi、Nikawa Takeshi
    • 雑誌名

      Life Science Alliance

      巻: 4 ページ: e202000849

    • DOI

      10.26508/lsa.202000849

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [備考] Google Scholar

    • URL

      https://scholar.google.com/citations?user=9LJeX5sAAAAJ&hl=en

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公開日: 2024-12-25  

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