放線菌プロモーターのリソースライブラリーの構築

2023 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 19K05806
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分38020:応用微生物学関連
• 研究機関: 国立感染症研究所
• 研究代表者: 石川 淳 国立感染症研究所, 品質管理研究センター, 主任研究官 (40202957)
• 研究分担者: 星野 泰隆 国立感染症研究所, 真菌部, 主任研究官 (40399457)
• 研究期間 (年度): 2019-04-01 – 2024-03-31
• キーワード: 放線菌 / プロモーター

研究成果の概要

課題番号26430201で得た高品質なTSS（Transcriptional Start Site）を精査し、プロモーター候補配列が位置すると考えられる3,220本のTSSの上流配列を得て、それらの配列中の6-mer（4,096通り）の分布を探索した結果、88個の6-merが見いだされた。次に、各6-mer毎の出現位置と出現回数を解析した結果、TSSの上流の-12および-40周辺に高頻度で出現する6-mer（プロモーターに特徴的な配列）を見出し、-12近辺に出現する6-merと-40近辺に出現する6-merの両方を含む上流配列を探索した結果、31本のプロモーター候補配列を見出した。

自由記述の分野

微生物ゲノム

研究成果の学術的意義や社会的意義

多剤耐性菌の問題の深刻化など、新たな抗生物質の登場が切望されているが、既存抗生物質の誘導体ではない真に新しい抗生物質を開発するために、ゲノム情報を用いた開発が行われている。しかしながら、その道具立ては十分とは言えず、さらに、放線菌のプロモーターに関する網羅的な研究は数例しかないため、遺伝子発現を自在に操作し得る多様なプロモーターを含むリソースの提供は、抗生物質開発などの放線菌ゲノム工学ばかりでなく、放線菌の学術的理解に資すると考えられる。