研究課題/領域番号 |
19K06102
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研究機関 | 滋賀県立琵琶湖博物館 |
研究代表者 |
天野 一葉 (桝永一葉) 滋賀県立琵琶湖博物館, 研究部, 特別研究員 (50526316)
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研究分担者 |
石橋 靖幸 国立研究開発法人森林研究・整備機構, 森林総合研究所, 主任研究員 等 (80353580)
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研究期間 (年度) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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キーワード | 遺伝的多様性 / 外来鳥類 / 管理ユニット / マイクロサテライト / 遺伝的分化 / 特定外来生物 / 集団の遺伝的構造 / 保全生態学 |
研究実績の概要 |
特定外来生物のソウシチョウは、近年日本各地の森林に侵入・定着して分布を拡大させ、在来鳥類群集を含めた地域の生態系に深刻な影響を与えている。本研究では、本種を広域な分布拡大期にある森林性外来鳥類のモデル動物として、既存の捕獲技術の改良や遺伝情報に基づいた駆除のための管理ユニットを設定することにより、効果的な管理手法の確立を目指す。本年度は関東北部および東北地域において捕獲調査を行い、ソウシチョウの血液サンプルの収集を行った。また今回の調査により関東北部・東北地方へソウシチョウ が分布を拡大させ、定着してきている状況や生息環境を確認できた。さらに分析に用いるマイクロサテライトDNAマーカーを増やすために、塩基配列の一部が分かっている11個のマイクロサテライト配列について不明部分の塩基配列を解読して、繰り返し配列の構成が単純な10座位を選択した。それらの泳動パターン解析から8座でアリルの判別が容易なことがわかり、先に開発したものと合わせて、分析に用いることのできる座位の数は22となった。次にこれらの座位について、筑波山の40個体のサンプルを用いて遺伝子型を調べると10座位については、増幅されないアリルを持つ可能性が示唆されたため、残りの12座位について分析を行うこととした。さらに多量のサンプルを効率良く分析するために分析方法を検討して、これら12座位は3回のPCR反応で増幅でき、3回の泳動で遺伝子型を決定できることを明らかにした。現在、これらのマイクロサテライト座位について国内地域集団サンプルの遺伝子型分析を進めている。さらに、ミトコンドリアDNAチトクロムb領域では遺伝距離の離れた異なるタイプが確認されており、集団の遺伝的な構造について解析が進んだ。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
日本のソウシチョウの生息状況についての情報収集や野外調査が進んだ。この研究に用いるDNAサンプルはすでに16地域で採取できている。アリルのデータを得やすいマイクロサテライトDNAマーカーを確定した。複数の座を同時に増やすためのPCRの条件の設定、分析の回数を少なくするためのマーカーの組み合わ せについて検討を終えた。新しいmtDNAマーカーも開発を終えた。
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今後の研究の推進方策 |
国内のサンプルの無い地域、少ない地域でソウシチョウの捕獲調査を行う。生息状況・捕獲条件の記録および血液サンプルの採集を行う。12座のマイクロサテラ イトDNAマーカーについて、各集団あたり30~40サンプルの解析を進める。ミトコンドリアDNAの塩基配列の決定を少数のサンプルについて行い、マイクロサテライトDNAとミトコンドリアDNAのデータから、国内の各ソウシチョウ地域集団の成立過程や集団間の遺伝的交流の大きさを推定する。
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次年度使用額が生じた理由 |
サンプル数の少ない地域があり、さらなる捕獲調査のために旅費の一部を繰り越した。また物品費の端数を次年度に繰り越した。そのため、研究費に残金が生じた。次年度の野外調査の旅費および物品費として使用する。
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