| 研究課題/領域番号 |
19K06243
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| 研究機関 | 国立研究開発法人水産研究・教育機構 |
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研究代表者 |
伏屋 玲子 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水産技術研究所(長崎), 主任研究員 (40373469)
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| 研究分担者 |
坂本 崇 東京海洋大学, 学術研究院, 教授 (40313390)
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| 研究期間 (年度) |
2019-04-01 – 2024-03-31
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| キーワード | クルマエビ / 性連鎖SNPマーカー / 性決定 / GRAS-Di解析 |
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| 研究実績の概要 |
クルマエビの新規ロングリード・ゲノムデータが公開され，そのリファレンスデータを用いて１家系のGRAS-Di解析データだけでなく，複数家系について再解析を行った。それぞれにおいて異なる性連鎖SNPが得られため，これらのSNPマーカーについてプライマーを設計した。また，2021年に海外で性連鎖SNPマーカーが報告されたため，そのマーカーのプライマーも用いて，天然のクルマエビおよび本課題で作成したクルマエビ家系について，PCRおよび電気泳動を行い，シーケンスデータから多型を調べ，解析からこれからの性連鎖SNPマーカーの位置関係についても解析をしている。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
コロナ禍で分担研究機関(東京海洋大学)で実験，解析が実施しにくい期間があり，またDNAで複数家系を使用した詳細な解析を行ったため，RNA-seq（外注）の実施ができなかった。
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| 今後の研究の推進方策 |
本課題で得られた性連鎖SNPマーカーを用いて，幼生のDNAによる雌雄判別を行い，RNA-seq解析を実施する。発生段階初期に雌雄差のある遺伝子をリストアップすることにより，性連鎖マーカーと連鎖する候補遺伝子の探索を行う。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
コロナ禍での分担機関での実験，解析が困難であった時期があったことから，研究期間の再延長を行ったため，次年度使用額が生じた。コロナが明けたことから，次年度繰越により，実験，解析を進めることで，全額使用が見込まれる。
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