| 研究課題/領域番号 |
19K06417
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| 研究機関 | 東京大学 |
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研究代表者 |
仁田 義弘 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 特任助教 (50829140)
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| 研究分担者 |
関崎 勉 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 教授 (70355163)
遠矢 真理 順天堂大学, 医学部, 助教 (20804694)
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| 研究期間 (年度) |
2019-04-01 – 2021-03-31
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| キーワード | レンサ球菌 / 選択培地 / 臨床細菌学 / 栄養要求性 |
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| 研究実績の概要 |
Streptococcus属菌特異的な16S rRNA遺伝子を標的としたPCRを開発した。25サイクル増幅によりStreptococus属菌に特異的に増幅するPCRを開発できた。しかし， 30サイクルだとEnterococcus faeciumで僅かな増幅が見られたが，実際の増幅バンドは電気泳動上で僅かに検出される程度で，真のStreptococcus属の増幅とは明らかに区別可能なため，実用上は問題ないと判断した。次いで，オムニログシステムを使用して240種の抗菌薬や化学物質などに対する感受性を評価した結果，Streptococcus属の発育は阻害せずLactococcus属の発育を阻害する5種の候補が見つかったが，いずれもEnterococcus属の発育は阻害せず， Streptococcus属菌選択培地に利用できる薬剤は見つからなかった。さらに，市販豚肉からStreptococcus属を分離培養する際に最も多く使用されるTH培地，それに市販のStreptococcus属菌選択用サプリメントを添加したTH+supplを用いて，市販豚肉から調整した試料を接種し，発育したコロニーから全DNAを抽出して， 16S rRNA遺伝子増幅産物に対するメタゲノム解析を実施した。元の豚肉試料では，Pseudomonas属，Acinetobacter属が全体の約70%を占め，Streptococcus属は約5%だった。TH培地ではLactococcus属が約40%，Macrococcus属が約25%，Enterococcus属が2%を占め，Streptococcus属は1%程度に減少した。さらにTH+suppl培地では，Lactococcus属が約82%，Enterococcus属が約8%なのに，Streptococcus属は1%未満に減少し，選択培地が目的を果たしていないことが判明した。
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