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2021 年度 実績報告書

真空紫外円二色性と直線二色性法による膜結合蛋白質の精密構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 19K06587
研究機関広島大学

研究代表者

松尾 光一  広島大学, 放射光科学研究センター, 准教授 (40403620)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
キーワードマガイニン2ペプチド / リポソーム / 円二色性 / 放射光 / 構造変化 / 二次構造 / 中間体
研究実績の概要

真空紫外円二色性(VUVCD)によるタンパク質の二次構造(含量・本数・配列)解析法を用いて、水溶性タンパク質の膜結合構造の研究を展開している。本年度は、モデル抗菌ペプチドであるマガイニン2(M2)と生体膜の相互作用のメカニズムを、VUVCDスペクトルのglobal fitting解析、直線二色性(LD)、膜の安定性が観測できる蛍光異方性を用いて明らかにし、M2の膜結合構造とその機能との関係性について検討した。
生体膜は、緑膿菌等の細胞膜に存在するDPPG脂質分子から粒径100 nmのリポソームを調製し利用した。VUVCDとLDの測定は、HiSORのビームライン12にて実施し、また蛍光異方性は蛍光分光光度計を用いて測定した。
VUVCD測定の結果、M2は脂質対ペプチド(L/P)比の増加に伴い、中間状態を経由してランダムコイル構造からαヘリックス構造に変化することが分かった。得られたVUVCDデータに対して吸着モデルを用いたglobal fitting解析から、L/P比の減少に伴い、M2は生体膜上でαヘリックスの単量体から、中間状態であるβシート構造の多量体(凝集体)に変化することが分かった。Flow状態でLDを測定した結果、βシートに由来するLDが得られ、生体膜表面に対するβシートの配向構造が決定された。さらに、βシート凝集体の生体膜安定性への影響を蛍光異方性で調べた結果、凝集体はDPPGリポソームの脂質二重層構造を不安定化させることが分かった。以上の結果から、生体膜上でのM2のβシート凝集体形成が、抗菌作用に重要であることが示唆された。

  • 研究成果

    (25件)

すべて 2022 2021 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (13件) (うち国際学会 6件、 招待講演 1件) 図書 (2件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] NIOF(エジプト)

    • 国名
      エジプト
    • 外国機関名
      NIOF
  • [雑誌論文] Kinetics of denaturation and renaturation processes of double-stranded helical polysaccharide, xanthan in aqueous sodium chloride2022

    • 著者名/発表者名
      Y. Tomofui, K. Matsuo, K. Terao
    • 雑誌名

      Carbohydr. Polym.,

      巻: 275 ページ: 118681(11pages)

    • DOI

      10.1016/j.carbpol.2021.118681

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Formation of β-Strand Oligomers of Antimicrobial Peptide Magainin 2 Contributes to Disruption of Phospholipid Membrane2022

    • 著者名/発表者名
      M Kumashiro, R Tsuji, S Suenaga, K Matsuo
    • 雑誌名

      Membranes

      巻: 12 ページ: 131(15pages)

    • DOI

      10.3390/membranes12020131

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Helically aligned fused carbon hollow nanospheres with chiral discrimination ability2022

    • 著者名/発表者名
      J Maruyama, S Maruyama, Y Kashiwagi, M Watanabe, T Shinagawa, T Nagaoka, T Tamai, N Ryu, K Matsuo, M Ohwada, K Chida, T Yoshii
    • 雑誌名

      Nanoscale

      巻: 14 ページ: 3748 - 3757

    • DOI

      10.1039/D1NR07971A

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Conformation of myelin basic protein bound to phosphatidylinositol membrane characterized by vacuum-ultraviolet circular-dichroism spectroscopy and molecular dynamics simulations.2021

    • 著者名/発表者名
      M. Kumashiro, Y. Izumi, K. Matsuo
    • 雑誌名

      Proteins

      巻: 89 ページ: 1251-1261

    • DOI

      10.1002/prot.26146

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Secondary structure of human De Novo evolved gene product NCYM analyzed by vacuum-ultraviolet circular dichroism2021

    • 著者名/発表者名
      T. Matsuo, K. Nakatani, T. Setoguchi, K. Matsuo, T. Tamada, Y. Suenaga
    • 雑誌名

      Front. Oncol.

      巻: 11 ページ: 688852 (10page)

    • DOI

      10.3389/fonc.2021.688852

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effects of Mono-Saccharides on Structural Stabilization of Apo-Myoglobin Studied by Synchrotron-Radiation Circular-Dichroism Spectroscopy2021

    • 著者名/発表者名
      T. Shimizu, A. Uomi, M. Kumashiro, Y. Izumi, K. Matsuo
    • 雑誌名

      HiSOR Activity Reports

      巻: 2020 ページ: 101-102

  • [雑誌論文] Study of Membrane-Bound Conformation and Pore Formation of Magainin2 using Vacuum-Ultraviolet Circular-Dichroism Spectroscopy2021

    • 著者名/発表者名
      R. Tsuji, M. Kumashiro, K. Matsuo
    • 雑誌名

      HiSOR Activity Reports

      巻: 2020 ページ: 103

  • [雑誌論文] Effect of Concentration on the Thermal Denaturation of Collagen2021

    • 著者名/発表者名
      Y. Maki, K. Matsuo
    • 雑誌名

      HiSOR Activity Reports

      巻: 2020 ページ: 104-105

  • [学会発表] Orientation Analysis of Antimicrobial Peptide Magainin 2 Bound to Phospholipid Membrane by Synchrotron-Radiation Linear Dichroism Spectroscopy2022

    • 著者名/発表者名
      Munehiro Kumashiro, Ryoga Tsuji, Shoma Suenaga, Koichi Matsuo
    • 学会等名
      The 26th Hiroshima International Symposium on Synchrotron Radiation
    • 国際学会
  • [学会発表] Analysis of structural change of XRCC4 by pseudo-phosphorylation using VUV-CD and SAXS2022

    • 著者名/発表者名
      Kai Nishikubo Maho Hasegawa, Yudai Izumi, Kentaro Fujii , Koichi Matsuo, Yoshihisa Matsumoto, Akinari Yokoya
    • 学会等名
      The 26th Hiroshima International Symposium on Synchrotron Radiation
    • 国際学会
  • [学会発表] Membrane-Bound Conformations of Magainin 2 depending on the Inherent Characteristics of Membrane Revealed by Synchrotron-Radiation Circular Dichroism Spectroscopy2022

    • 著者名/発表者名
      Ryoga Tsuji, Munehiro Kumashiro, Koichi Matsuo
    • 学会等名
      The 26th Hiroshima International Symposium on Synchrotron Radiation
    • 国際学会
  • [学会発表] Development of Time-Resolved Vacuum-Ultraviolet Circular Dichroism Spectroscopy and its Application to the Interaction Analysis betweenβ-Lactoglobulin and Lipid Membrane2022

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Hashimoto, Koichi Matsuo
    • 学会等名
      The 26th Hiroshima International Symposium on Synchrotron Radiation
    • 国際学会
  • [学会発表] Observation of Liquid-Liquid Phase Separation of FUS-LC using VUV-CD Spectroscopy2022

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Fujii, Nobuo Maita, Koichi Matsuo, Masato Kato
    • 学会等名
      The 26th Hiroshima International Symposium on Synchrotron Radiation
    • 国際学会
  • [学会発表] 放射光円二色性・直線二色性・蛍光異方性によるマガイニン2の膜 誘起β凝集体形成の解析2022

    • 著者名/発表者名
      熊代 宗弘、末永 翔磨、松尾 光一
    • 学会等名
      第35回日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム
  • [学会発表] VUV-CDによるFUS-LCの相分離転移に伴う二次構造変化の観測2022

    • 著者名/発表者名
      藤井 健太郎、真板 宣夫、加藤 昌人、松尾 光一
    • 学会等名
      第35回日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム
  • [学会発表] Desiccation-Induced Conformational Change of Group 3 LEA Protein in the presence of Membrane Characterized by Vacuum-Ultraviolet Circular Dichroism Spectroscopy2022

    • 著者名/発表者名
      Shun Sawada, Munehiro Kumashiro, Ryota Imaura, Koichi Matsuo
    • 学会等名
      The 26th Hiroshima International Symposium on Synchrotron Radiation
    • 国際学会
  • [学会発表] 脂質分子の特性に依存するマガイニン 2 の膜結合構造2021

    • 著者名/発表者名
      辻 怜河, 熊代 宗弘, 松尾 光一
    • 学会等名
      第59回 日本生物物理学会年会
  • [学会発表] 放射光円二色性・直線二色性・蛍光異方性により明確化された生体膜に誘起された マガイニン 2β 凝集体の特徴2021

    • 著者名/発表者名
      熊代 宗弘, 末永 翔磨, 松尾 光一
    • 学会等名
      第59回 日本生物物理学会年会
  • [学会発表] 真空紫外円二色性と直線二色性によるαシヌクレインの生体膜相互作用研究2021

    • 著者名/発表者名
      今浦 稜太、熊代 宗弘、河田 康志、 松尾 光一
    • 学会等名
      第22回日本蛋白質科学会年会
  • [学会発表] 放射光円二色性・直線二色性・蛍光異方性による抗菌ペプチドマガイニン2の膜結合 により誘起された β-sheet 凝集体の研究2021

    • 著者名/発表者名
      熊代宗弘,末永翔 磨,松尾光一
    • 学会等名
      Molecular Chirality 2021
  • [学会発表] 放射光円二色性分光法と 生体分子の構造研究2021

    • 著者名/発表者名
      松尾光一
    • 学会等名
      サントリー生命科学財団  オンラインセミナー
    • 招待講演
  • [図書] 疾患の原因遺伝子・タンパク質の解析技術と創薬/診断技術への応用 (第2章第3節 真空紫外円二色性法による疾患原因タンパク質の構造解析)2022

    • 著者名/発表者名
      松尾 光一,熊代 宗弘
    • 総ページ数
      564(内 p136~p145)
    • 出版者
      (株)技術情報協会
    • ISBN
      978-4-86104-877-7
  • [図書] 紫外可視・蛍光分光法(第4章 円偏光分光法 4.1旋光分散計と円二色性、4.4円二色性分光法の実際)2021

    • 著者名/発表者名
      築山光一/星野翔麻・編著
    • 総ページ数
      320(内 p183~p202, p227-p238)
    • 出版者
      株式会社講談社サイエンティフィク
    • ISBN
      978-4-06-523805-9
  • [備考] 神経ネットワークの形成に必要な「糊」タンパク質の構造の初観測

    • URL

      http://www.hsrc.hiroshima-u.ac.jp/research/result/57.html

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公開日: 2022-12-28  

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