生体から直接抽出してきたタンパク質の動的構造を調べるために、我々はMALDI MSによるH/D交換実験に着目し、専門外の研究者が容易に使えるソフトウェアを開発した(フリーで配布を始めた)。このソフトウェアは様々な解析を自動的に行うだけでなく、同位体取り込みの異なる分子の存在比まで示すことができた。また、自らソフトウェア開発できる利点を生かし生体から抽出できるタンパク質量で静的な構造からは予想できなかった動的構造の変化を敏感に捉えることに成功した。更にタンパク質内で同じ構造クラスター内にある水素の数や溶媒露出度を算出すること成功した。
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