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2020 年度 実施状況報告書

植物ゲノムにおける転移因子由来非コードRNAの転写制御

研究課題

研究課題/領域番号 19K06619
研究機関沖縄科学技術大学院大学

研究代表者

佐瀬 英俊  沖縄科学技術大学院大学, 植物エピジェネティクスユニット, 准教授 (70510006)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
キーワードトランスポゾン / 非コードRNA / シロイヌナズナ / エピゲノム
研究実績の概要

研究課題:植物ゲノムにおける転移因子由来非コードRNAの転写制御 植物ゲノムでは進化の過程で遺伝子内部の非翻訳領域(インントロンやUTR配列)に転移因子(トランスポゾン)が大量に蓄積されている。これまでの研究から我々は遺伝子内転移因子の内在性プロモーターから遺伝子プロモーターとは独立の非コードRNAの転写が引き起こされていることを見出している。本研究課題では植物ゲノムを対象に遺伝子内部に存在するトランスポゾン由来の潜在性プロモーター(cryptic promoter)解析やトランスポゾン抑制に異常をきたす変異体の解析を通して、遺伝子領域に存在するトランスポゾン由来の非コードRNA転写制御メカニズムとその機能を明らかにすることを目的とする。2020年度はシロイヌナズ ナにおけるゲノムワイドな転写開始点の研究成果を論文として発表した(Le et al., 2020).

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

2020年度はこれまでの成果を論文として発表することができた。

今後の研究の推進方策

今後は検出された転写開始点のエピジェネティック制御の生物学的意味を見出すよう試みる。

  • 研究成果

    (2件)

すべて 2020

すべて 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (1件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Epigenetic regulation of spurious transcription initiation in Arabidopsis2020

    • 著者名/発表者名
      Le NT, Harukawa Y, Miura S, Boer D, Kawabe A, Saze H.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 ページ: 3224

    • DOI

      10.1038/s41467-020-16951-w

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] 植物における遺伝子内トランスポゾン配列の抑制的クロマチン修飾の維持機構2020

    • 著者名/発表者名
      佐瀬英俊
    • 学会等名
      日本植物学会
    • 招待講演

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公開日: 2021-12-27  

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