研究課題
基盤研究(C)
遺伝子共発現解析は発現プロファイルが似ている遺伝子群を特定することで、遺伝子の機能推定を行う手法である。公共のリポジトリに蓄積している大量の遺伝子発現データは多様な環境を反映しているが、サンプルの偏りをどのように扱うかが問題となる。本研究では、主成分分析を用いて遺伝子発現データを再構成し、アンサンブル計算と組み合わせることで、高精度の共発現情報を抽出できることを見出した。
バイオインフォマティクス
本研究では、データを収集する際のサンプリングバイアスを事後処理によって軽減する手法を提案し、公共のトランスクリプトームデータに基づく遺伝子ネットワーク解析を大きく改善することに成功した。サンプリングバイアスは大規模データを扱う上での大きな問題であり、それを解決する本手法は広い分野に適用できる可能性がある。
