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2021 年度 実績報告書

クロロフィル代謝における酵素の誕生と進化

研究課題

研究課題/領域番号 19K06700
研究機関北海道大学

研究代表者

田中 歩  北海道大学, 低温科学研究所, 名誉教授 (10197402)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
キーワード進化 / クロロフィル
研究実績の概要

物質、エネルギー代謝は生命活動の中心的な役割を担っている。それらを構成する酵素がどのように誕生し、新しい代謝経路が出現したのかは、生物進化の研究において最も興味深い問いの一つである。そのため、これまでに様々な手法を用いてこれらの課題に取り組まれてきた。酵素は生理的な役割を担う触媒活性以外に、生理的には意味のない触媒活性(promiscuous activity)を併せ持っている。本研究の目的は、このpromiscuousな活性がどのようにして新しい酵素の誕生へとつながったのかを明らかにし、酵素の誕生と進化のモデルを提案することである。
陸上植物のクロロフィルの分解は、中心金属のマグネシウムがマグネシウム脱離酵素により外されることから始まる。クロロフィルの代謝系は、陸上植物の祖先に共生したシアノバクテリア由来のものであると考えられているが、シアノバクテリアはマグネシウム脱離酵素を持たない。データベースを検索したところ、植物のマグネシウム脱離酵素はバクテリア由来であることが示唆された。そこでバクテリアの遺伝子の組み換えタンパク質を作製し、酵素活性を調べた。その結果、植物のマグネシウム脱離酵素はクロロフィルaのみを基質にするのに対して、バクテリアの組み換えタンパク質はクロロフィルaとともにクロロフィルbも代謝できることが示された。この結果は陸上植物がクロロフィルの分解系という新たな代謝系を獲得する過程で、基質特異性を高め代謝系の冗長性を抑制していることを示している。さらに、このタンパク質の結晶構造を決定し、アミノ酸置換体を用いた生化学的な解析と総合することによりその反応機構を提唱した。
本研究の成果は、遺伝子の改変による人工的な代謝系を利用した有用物質の生産などに応用できる可能性がある。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2022 2021

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 1件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 1件)

  • [雑誌論文] Characterization of photosystem II assembly complexes containing ONE-HELIX PROTEIN1 in Arabidopsis thaliana2022

    • 著者名/発表者名
      Maeda Hanaki、Takahashi Koharu、Ueno Yoshifumi、Sakata Kei、Yokoyama Akari、Yarimizu Kozue、Myouga Fumiyoshi、Shinozaki Kazuo、Ozawa Shin-Ichiro、Takahashi Yuichiro、Tanaka Ayumi、Ito Hisashi、Akimoto Seiji、Takabayashi Atsushi、Tanaka Ryouichi
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research

      巻: 135 ページ: 361~376

    • DOI

      10.1007/s10265-022-01376-x

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Unique Peripheral Antennas in the Photosystems of the Streptophyte Alga Mesostigma viride2021

    • 著者名/発表者名
      Aso Michiki、Matsumae Renon、Tanaka Ayumi、Tanaka Ryouichi、Takabayashi Atsushi
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 62 ページ: 436~446

    • DOI

      10.1093/pcp/pcaa172

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Substitution of Deoxycholate with the Amphiphilic Polymer Amphipol A8-35 Improves the Stability of Large Protein Complexes during Native Electrophoresis2021

    • 著者名/発表者名
      Kameo Shinsa、Aso Michiki、Furukawa Ryo、Matsumae Renon、Yokono Makio、Fujita Tomomichi、Tanaka Ayumi、Tanaka Ryouichi、Takabayashi Atsushi
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 62 ページ: 348~355

    • DOI

      10.1093/pcp/pcaa165

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Insights into the structure and function of the rate-limiting enzyme of chlorophyll degradation through analysis of a bacterial Mg-dechelatase homolog2021

    • 著者名/発表者名
      Dey Debayan、Dhar Dipanjana、Fortunato Helena、Obata Daichi、Tanaka Ayumi、Tanaka Ryouichi、Basu Soumalee、Ito Hisashi
    • 雑誌名

      Computational and Structural Biotechnology Journal

      巻: 19 ページ: 5333~5347

    • DOI

      10.1016/j.csbj.2021.09.023

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Enrichment of chlorophyll catabolic enzymes in grana margins and their cooperation in catabolic reactions2021

    • 著者名/発表者名
      Fukura Koki、Tanaka Ayumi、Tanaka Ryouichi、Ito Hisashi
    • 雑誌名

      Journal of Plant Physiology

      巻: 266 ページ: 153535~153535

    • DOI

      10.1016/j.jplph.2021.153535

    • 査読あり

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公開日: 2022-12-28  

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