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2021 年度 実施状況報告書

単細胞生物におけるプログラム細胞死の進化に関する数理生態学的研究

研究課題

研究課題/領域番号 19K06851
研究機関京都大学

研究代表者

山内 淳  京都大学, 生態学研究センター, 教授 (40270904)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2023-03-31
キーワード移住モデル / 多種共存 / ランク-アバンダンス曲線 / 競争力-繁殖力トレードオフ
研究実績の概要

本研究課題「単細胞生物におけるプログラム細胞死の進化に関する数理生態学的研究」の遂行において、単細胞生物の種内の系統間の競争を数理モデルとして記述する必要があったが、それに関して生物種の多種共存を理論化した移住モデル(colonization model)が応用できることに思い至った。この移住モデルを用いた解析を進める中で、そのモデルの本来ターゲットである多種共存の問題に発展の余地があることに気づき、この間、その課題について取り組んできた。
各種の競争能力と繁殖能力の間にトレードオフを仮定すると、移住モデルにおいて多種の共存が実現する。その群集についてランク-アバンダンス曲線を描くと、その曲線上における種の配置に特徴的なパターンが現れる。 すなわち、種間でのランクの距離(差)が様々な近縁ペア間で比較的同じような値になり、また、近縁な種が存在する種はランク-アバンダンス曲線上で高いランクか低いランクに偏って分布する傾向が見られる。これらを踏まえ、1つのコウモリの群集と2つの鳥の群集について、ニッチが類似している近縁種のペアのランク-アバンダンス曲線上での位置関係を調べ、それらが確かにモデルの予測と一致する傾向があることを見出した。この研究成果はEcology and Evolution誌に発表された(Yamauchi et al., 2021a)。また、この多種共存の研究から派生して、多種共存理論に関する総説を、日本と韓国の研究者との共著により、書籍の1章として発表した(Yamauchi et al., 2021b)。
これらを含む研究成果は、2021年度に開催された国内の学会での一般発表に加え、2件の国際シンポジウムでの招待講演において発表している。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

コロナウィルスの蔓延により、当初予定していた国際学会への参加や海外渡航が軒並みキャンセルとなり、十分な情報収集が行えなかったことから計画は遅れ気味である。また、本来の研究課題である「単細胞生物におけるプログラム細胞死」の研究に必要な手法の整備から派生した「移住モデルに基づく多種共存理論」の研究に取り組んでいたことによっても、当初の研究課題の進捗は遅れ気味となった。研究費の繰越によって研究期間を延長し、最終年度中に数本の研究論文を出版することを目指して準備中である。
当初計画していた研究課題は本研究期間内では完了できない可能性もあるが、その遂行に必要な理論的手法の整備は完了したいと考えている。

今後の研究の推進方策

本来の研究課題である「単細胞生物におけるプログラム細胞死」の研究を推進するための理論的枠組みとして移住モデルを用いることとしたが、そのモデルの性質は必ずしも十分に解明されているわけではなかった。今後、当初の研究課題への取り組みを可能とすべく、少なくとも移住モデルの基礎的な性質の解明を進めておきたいと考えている。
例えば、各種のサイトへの移住確率が幼生の数によって決まる場合と、幼生プール中の幼生の比率によって決まる場合では、種の頻度のダイナミクスのパターンが大きく変化することが分かってきた。このことは、多種の共存はもちろん、種内での系統の共存機構にも示唆を与える知見である。本研究期間中には当初の研究計画を達成できないかもしれないが、アプローチの基盤をなす理論モデルについての情報を整備することで、今後の研究への取り組みの道筋をつける計画である。

次年度使用額が生じた理由

コロナウィルスの蔓延に伴い、参加を予定していた国際学会への参加や海外の研究者との研究打ち合わせが遂行できなくなり、支出が減少した。今年度中に、可能であれば海外の研究会などに参加し、研究の成果を発表したいと考えている。また、この間の進捗の遅れを埋め合わせるために、国内の研究機関等を訪問し研究の成果について議論を行いたいと考えている。

  • 研究成果

    (12件)

すべて 2022 2021 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 2件、 招待講演 2件) 図書 (1件)

  • [国際共同研究] Pusan University(韓国)

    • 国名
      韓国
    • 外国機関名
      Pusan University
  • [雑誌論文] Density regulation of co-occurring herbivores via two indirect effects mediated by biomass and non-specific induced plant defenses2021

    • 著者名/発表者名
      Yamauchi Atsushi、Ikegawa Yusuke、Ohgushi Takayuki、Namba Toshiyuki
    • 雑誌名

      Theoretical Ecology

      巻: 14 ページ: 41~55

    • DOI

      10.1007/s12080-020-00479-2

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Colonization process determines species diversity via competitive quasi‐exclusion2021

    • 著者名/発表者名
      Yamauchi Atsushi、Ito Koichi、Shibasaki Shota
    • 雑誌名

      Ecology and Evolution

      巻: 11 ページ: 4470~4480

    • DOI

      10.1002/ece3.7342

    • 査読あり
  • [学会発表] 栄養の添加による植物群集の構造変化に関する理論的研究2022

    • 著者名/発表者名
      山内淳, 伊藤公一, 柴崎祥太
    • 学会等名
      日本生態学会
  • [学会発表] 植物の個体間相互作用が被食防衛と資源獲得への投資の共進化に及ぼす影響2022

    • 著者名/発表者名
      瀬川有太郎, 伊藤公一, 山内淳
    • 学会等名
      日本生態学会
  • [学会発表] 柔軟な繁殖投資様式を考慮した資源収支モデルにおけるマスティング戦略2022

    • 著者名/発表者名
      仲畑了, 伊藤公一, 山内淳
    • 学会等名
      日本生態学会
  • [学会発表] 競争的群集における無数の不規則な軌道を伴う多種共存2021

    • 著者名/発表者名
      山内淳, 伊藤公一, 柴﨑祥太, 難波利幸
    • 学会等名
      日本数理生物学会
  • [学会発表] 植物の個体間相互作用が被食防衛と資源獲得への投資の共進化に及ぼす影響2021

    • 著者名/発表者名
      瀬川有太郎, 山内淳, 伊藤公一
    • 学会等名
      日本数理生物学会
  • [学会発表] 植物の個体間相互作用が被食防衛と資源獲得への投資の共進化に及ぼす影響2021

    • 著者名/発表者名
      瀬川有太郎, 山内淳, 伊藤公一
    • 学会等名
      個体群生態学会大会
  • [学会発表] Theory of species replacements under long-term fertilization in plant communities2021

    • 著者名/発表者名
      Yamauchi A, Ito K, Shibasaki S.
    • 学会等名
      International Workshop "From Behavior to Biodiversity Liking with Population Invasion and Establishment"
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Competition model explains trends of long-term fertilization in plant communities2021

    • 著者名/発表者名
      Yamauchi A.
    • 学会等名
      International Symposium on the Advances of Ecology
    • 国際学会 / 招待講演
  • [図書] Short Notes on Theories of Species Diversity. (In: Creative Complex System. Eds. Nishimura K, Murase M, Yoshimura K)2021

    • 著者名/発表者名
      Yamauchi A, Tokita K, Namba T, Chon T-S
    • 総ページ数
      33-53
    • 出版者
      Springer.
    • ISBN
      978-9811644566

URL: 

公開日: 2022-12-28  

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