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2019 年度 実施状況報告書

三次元構造制御を鍵とした分子設計に基づく機能性ペプチドの開発

研究課題

研究課題/領域番号 19K06965
研究機関北海道大学

研究代表者

渡邉 瑞貴  北海道大学, 薬学研究院, 講師 (20507173)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
キーワードフォルダマー / 配座制御 / ペプチド / ヘリックス
研究実績の概要

本研究は、細胞内タンパク質間相互作用を標的可能な新たなペプチド創薬方法論の確立を目指し、分子全体の三次元構造を制御することによって機能化したペプチドを創製に取り組んだ。具体的には、シクロプロパンの構造特性を利用して配座を高度に制御した光学活性シクロプロパンδ-アミノ酸を鍵ユニットとした分子設計による(I)タンパク質間相互作用に重要なαヘリックス上の側鎖官能基の空間配置を模倣したペプチドフォルダマー、および(II)配座制御によって高い細胞膜透過性を有した環状ペプチドの設計・合成・立体構造解析を実施した。
まず、分子動力学計算を活用し、三次元構造を予測をしながら、シクロプロパンの構造特性を利用して配座を高度に制御した光学活性シクロプロパンδ-アミノ酸を鍵ユニットとしたオリゴマーや環状ペプチドの分子設計を行った。次に、分子設計した分子の有機化学合成に取り組んだ。トランス体の構成ユニットは、光学活 性グリシドールを出発原料とし、立体選択的なシクロプロパン構築反応、不斉補助基を利用した立体選択的Grignard反応、および、不斉アルキル化を経て、18工程で合成した。シス体の構成ユニットは、光学活性エピクロロヒドリンからの立体選択的にシクロプロパン骨格を構築し、ヒドロホウ素化からのシス選択的な酸化反応などを経て合成した。合成したペプチドフォルダマー分子は、NMRおよびCD測定、およびX線結晶構造解析によって、その三次元構造解析を実施し、分子設計で期待した通りのヘリックス構造をとっていることを確認した。環状ペプチドは、膜透過性の評価を実施し、構造による膜透過性の差を考察した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

目的の立体化学を有した光学活性シクロプロパンδ-アミノ酸を、不斉補助基を利用した立体選択的Grignard反応および不斉アルキル化を経て、合成することができた。また、合成したシクロプロパンδ-アミノ酸を種々の長さのオリゴマーへと誘導することもでき、一部のオリゴマーは、その結晶化にも成功した。三次元立体構造の確認もほぼ完了し、学術論文へと投稿できるところまで実験データが集まった。以上の結果より、おおむね順調に進展していると判断した。

今後の研究の推進方策

さらに新たなオリゴマーおよび環状ペプチドを設計し、合成する。それらの溶液中および結晶の三次元構造を、NMR, CD, XRDなどの測定により、実験的に明らかにする。分子設計で期待した通りの三次元構造かどうか、確認する。膜透過性は、人工膜アッセイ (PAMPA) および Caco-2細胞で評価する。化学構造―三次元構造―膜透過性の三者相関を解析し、分子設計にフィードバックする。
さらに、抗がん薬の創薬標的 (I) p53/MDM2相互作用および(II)シグナル伝達転写因子STAT3の二量化を阻害する(I)フォルダマー型ペプチドおよび(II)膜透過性環状ペプチドの創製を目指す。

次年度使用額が生じた理由

年度末に学会(日本薬学会年会、日本化学会春季年会)への参加を計画していたものの、新型コロナ感染症拡大の影響を受けて当該学会の開催が中止となったため、旅費として確保していた分が余剰金となった。
次年度には、研究を遂行するために必要な実験消耗品(試薬など)の購入へと適切に使用する予定である。

  • 研究成果

    (16件)

すべて 2020 2019

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件) 学会発表 (12件) (うち国際学会 2件、 招待講演 3件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Development of a Highly Potent Analogue and a Long-Acting Analogue of Oxytocin for the Treatment of Social Impairment-Like Behaviors2019

    • 著者名/発表者名
      Ichinose Wataru、Cherepanov Stanislav M.、Shabalova Anna A.、Yokoyama Shigeru、Yuhi Teruko、Yamaguchi Hiroaki、Watanabe Ayu、Yamamoto Yasuhiko、Okamoto Hiroshi、Horike Shinichi、Terakawa Junpei、Daikoku Takiko、Watanabe Mizuki、Mano Nariyasu、Higashida Haruhiro、Shuto Satoshi
    • 雑誌名

      Journal of Medicinal Chemistry

      巻: 62 ページ: 3297~3310

    • DOI

      10.1021/acs.jmedchem.8b01691

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Synthesis of oxytocin derivatives lipidated via a carbonate or carbamate linkage as a long-acting therapeutic agent for social impairment-like behaviors2019

    • 著者名/発表者名
      Cherepanov Stanislav M.、Miura Risako、Shabalova Anna A.、Ichinose Wataru、Yokoyama Shigeru、Fukuda Hayato、Watanabe Mizuki、Higashida Haruhiro、Shuto Satoshi
    • 雑誌名

      Bioorganic & Medicinal Chemistry

      巻: 27 ページ: 3358~3363

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2019.06.018

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nutrient-Based Chemical Library as a Source of Energy Metabolism Modulators2019

    • 著者名/発表者名
      Furuta Tomoyuki、Mizukami Yuya、Asano Lisa、Kotake Kenjiro、Ziegler Slava、Yoshida Hiroki、Watanabe Mizuki、Sato Shin-ichi、Waldmann Herbert、Nishikawa Makiya、Uesugi Motonari
    • 雑誌名

      ACS Chemical Biology

      巻: 14 ページ: 1860~1865

    • DOI

      10.1021/acschembio.9b00444

    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] シクロプロパンδ-アミノ酸を基盤としたヘリカルフォルダマーの開発2020

    • 著者名/発表者名
      渡邉瑞貴
    • 学会等名
      日本薬学会 第140年会
    • 招待講演
  • [学会発表] シクロプロパン鎖導入環状ペプチド化合物の膜透過性および吸収性の評価2020

    • 著者名/発表者名
      加藤 七海、植村 真衣、松井 耕平、渡邉 瑞貴、武隈 洋、周東 智、菅原 満
    • 学会等名
      日本薬学会 第140年会
  • [学会発表] Design and synthesis of novel helical foldamers based on cyclopropane δ-amino acids2020

    • 著者名/発表者名
      WATANABE, Mizuki; NAGATA, Makoto; TAKEUCHI, Kou; DOI, Ryohei; FUJIWARA, Koichi; SATO, Yoshihiro; SHUTO, Satoshi
    • 学会等名
      日本化学会第100春季年会
  • [学会発表] シクロプロパン骨格を有する大環状ペプチドライブラリーの構築及び応用2020

    • 著者名/発表者名
      大熊 里佳・桑原 智希・渡邉 瑞貴・周東 智・後藤 佑樹・菅 裕明
    • 学会等名
      日本化学会第100春季年会
  • [学会発表] 配座制御を基盤とした分子設計による創薬化学研究2019

    • 著者名/発表者名
      渡邉瑞貴
    • 学会等名
      日本薬学会北海道支部第146回例会
    • 招待講演
  • [学会発表] Improvement of Membrane Permeability of Cyclic Peptides By Conformational Restriction Using Cyclopropane2019

    • 著者名/発表者名
      Mizuki Watanabe, Yukina Sato, Mai Uemura, Nanami Kato, Kouhei Matsui, Yoh Takekuma, Mitsuru Sugawara, Koh Takeuchi, Satoshi Shuto
    • 学会等名
      23rd Korean Peptide Protein Society Symposium
    • 国際学会
  • [学会発表] 配座制御による環状ペプチドの膜透過性の向上2019

    • 著者名/発表者名
      渡邉瑞貴
    • 学会等名
      第14回トランスポーター研究会
    • 招待講演
  • [学会発表] シクロプロパンδ-アミノ酸を基盤とした新規フォルダマーの開発2019

    • 著者名/発表者名
      永田真, 土井良平, 竹内恒、亀田倫史、藤原広一, 渡邉瑞貴, 周東智
    • 学会等名
      第52回若手ペプチド夏の勉強会
  • [学会発表] 配座制御を基盤とした細胞膜透過性・STAT3二量化阻害環状ペプチドの創製研究2019

    • 著者名/発表者名
      Takayuki Osada, Kouhei Matsui, Katsumi Ota, Koichi Fujiwara, Akira Asai, Mizuki Watanabe, and Satoshi Shuto
    • 学会等名
      第52回若手ペプチド夏の勉強会
  • [学会発表] Improvement of Membrane Permeability of Cyclic Peptides By Conformational Restriction Using Cyclopropane2019

    • 著者名/発表者名
      Mizuki Watanabe, Yukina Sato, Mai Uemura, Nanami Kato, Kouhei Matsui, Yoh Takekuma, Mitsuru Sugawara, Satoshi Shuto
    • 学会等名
      12th AFMC International Medicinal Chemistry Symposium
    • 国際学会
  • [学会発表] DESIGN AND SYNTHESIS OF NOVEL HELICAL FOLDAMERS2019

    • 著者名/発表者名
      永田真, 竹内恒、土井良平、亀田倫史、藤原広一, 佐藤美洋, 渡邉瑞貴, 周東智
    • 学会等名
      第56回ペプチド討論会
  • [学会発表] DEVELOPMENT OF MEMBRANE PERMEABLE CYCLIC PEPTIDES AS STAT3 DIMERIZATION INHIBITORS: A CONFORMATIONAL RESTRICTION STRATEGY FOR REGURATING PROTEIN-PROTEIN INTERACTIONS2019

    • 著者名/発表者名
      Takayuki Osada, Kouhei Matsui, Koichi Fujiwara, Katsumi Ota, Akira Asai, Mizuki Watanabe, and Satoshi Shuto
    • 学会等名
      第56回ペプチド討論会
  • [図書] ペプチド創薬の最前線2019

    • 著者名/発表者名
      木曽良明(監修)、吉矢拓、髙山健太郎、生長幸之助、金井求、西村仁孝、新原光貴、加藤敬行、菅裕明、出水庸介、小早川拓也、玉村啓和、 金井和昭、秋山泰、大上雅史、吉川寧、和久井直樹、鳴海哲夫、後藤佑樹、長谷川慎、田中誠、渡邉瑞貴
    • 総ページ数
      265
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • ISBN
      978-4-7813-1417-4

URL: 

公開日: 2021-01-27  

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