2021 年度研究成果報告書

MS/MSシミュレーションによる、修飾部位網羅的タンパク質リン酸化定量法の開発

研究課題

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研究課題/領域番号	19K07017
研究種目	基盤研究(C)
配分区分	基金
応募区分	一般
審査区分	小区分47020:薬系分析および物理化学関連
研究機関	名城大学
研究代表者	今西進名城大学, 薬学部, 准教授 (00757502)
研究期間 (年度)	2019-04-01 – 2022-03-31
キーワード	質量分析 / 定量プロテオミクス / タンパク質リン酸化 / シミュレーション / スペクトルライブラリ
研究成果の概要	以前開発したリン酸化ペプチドMS/MSスペクトルのシミュレーション用ソフトウェアSimPhosphoを応用し、データ非依存的質量分析法であるSWATH測定によるリン酸化ペプチドの定量解析法を開発した。SimPhosphoをTripleTOF質量分析計で取得したMS/MSスペクトルに対して用いた後、データフォーマットを調整することにより、SkylineソフトウェアによるSWATH解析でリン酸化ペプチドの定量が可能であることを確認した。さらにリン酸化部位を特異的かつ高感度に同定した上で定量解析が行えるよう、シミュレーション条件の最適化を行った。
自由記述の分野	プロテオミクス
研究成果の学術的意義や社会的意義	現在、生体タンパク質の網羅的解析（プロテオミクス）を行うことにより一度に数万ものリン酸化が観察でき、それら膨大な報告は、PhosphoSitePlusなどのデータベースに次々と蓄積されている。本研究では、網羅的定量解析におけるリン酸化部位の決定を高精度化したことにより、より信頼度の高いリン酸化の定量的な観察を可能にすると期待できる。リン酸化は細胞内情報伝達の中心を担っており、様々な生体機能の制御に関わっていることから、それらリン酸化の網羅的解析は今後の生命科学および医学・薬学のさらなる発展に貢献すると考えられる。