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2022 年度 実施状況報告書

ヘリコバクター・シネディの特定のクローンに存在する新規のゲノム修飾の役割解明

研究課題

研究課題/領域番号 19K07074
研究機関国立感染症研究所

研究代表者

林原 絵美子  国立感染症研究所, 細菌第二部, 室長 (20349822)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2024-03-31
キーワードPhosphorothioate化修飾 / Helicobacter cinaedi / DNA修飾 / メチル化 / Helicobacter / Dnd遺伝子
研究実績の概要

DNAのPhosphorothioate(PT)化修飾は最近近年明らかになった新規のDNA修飾であり,メチル化修飾では塩基がメチル化されるのに対し,PT化修飾ではデオキシリボースを繋ぐリン酸基の酸素が硫黄に置換される.メチル化修飾は外来DNAから自己のDNAを守るRestriction-Modification(RM)システムの一環であるだけでなく,遺伝子の発現調節を介して病原性や環境適応に寄与している.一方,PT化修飾の役割には不明な点が多い.そこで,本研究ではH. cinaediのPT化修飾が,病原性や環境適応においてどのような役割を果たしているのかに着目する.
今年度はCaco-2感染実験での評価とマウス感染実験での評価系を構築を行った。またSMRT法により同定したPT化の標的モチーフ(PT化されているのは一部のモチーフのみ)とトランスクリプトーム解析で発現変動のあった遺伝子について位置関係の解析を行った。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

評価系構築に時間を要したため。

今後の研究の推進方策

病原性への影響の評価の結果を取りまとめ、Helicobacter属菌で初めてPT化標的部位を同定し、その役割について検討した報告として論文化する予定である。

次年度使用額が生じた理由

年度末納品等にかかる支払いが令和5年4月1日以降となったため、当該支出分については次年度の実支出額に計上予定。令和4年度分についてはほぼ使用済みである。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (3件) (うちオープンアクセス 2件、 査読あり 1件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] ヒトに感染するHelicobacter属菌について2023

    • 著者名/発表者名
      林原 絵美子
    • 雑誌名

      日本臨床微生物学会雑誌

      巻: 33 ページ: 1-11

  • [雑誌論文] Characterization of HcaA, a novel autotransporter protein in Helicobacter cinaedi, and its role in host cell adhesion2022

    • 著者名/発表者名
      Aoki Sae、Mori Shigetarou、Matsui Hidenori、Shibayama Keigo、Kenri Tsuyoshi、Rimbara Emiko
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: - ページ: 517170

    • DOI

      10.1101/2022.11.18.517170

    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Determining Infected Aortic Aneurysm Treatment Using Focused Detection of Helicobacter cinaedi2022

    • 著者名/発表者名
      Jien Saito、Emiko Rimbara、Shingo Inaguma、Chihiro Hasegawa、Shinji Kamiya、Akihiro Mizuno、Yoshiaki Sone、Tatsuhito Ogawa、Yukihide Numata、Satoru Takahashi、Miki Asano
    • 雑誌名

      Emerging Infectious Diseases

      巻: 28 ページ: 1494~1498

    • DOI

      10.3201/eid2807.212505

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Characterization of novel autotransporter protein HcaA in Helicobacter cinaedi2022

    • 著者名/発表者名
      Sae Aoki, Shigetarou Mori, Hidenori Matsui, Keigo Shibayama, Tsuyoshi Kenri, Emiko Rimbara
    • 学会等名
      第96回日本細菌学会総会
  • [学会発表] Isolation and characterization of non-Helicobacter pylori Helicobacter species infecting human stomach2022

    • 著者名/発表者名
      Emiko Rimbara
    • 学会等名
      The 21th International Workshop on Campylobacter, Helicobacter and Related Organisms
    • 国際学会 / 招待講演

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公開日: 2023-12-25  

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