| 研究課題/領域番号 |
19K07135
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| 研究機関 | 熊本大学 |
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研究代表者 |
河原 哲平 熊本大学, 大学院生命科学研究部(薬), 特任准教授 (80822824)
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| 研究期間 (年度) |
2019-04-01 – 2024-03-31
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| キーワード | 干潟放線菌 / デレプリケーション / 統計学的手法 / 天然物ライブラリー |
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| 研究実績の概要 |
九州西岸部の大型閉鎖性内湾には日本最大の干潟が発達する。干潟はかつては無用の地とされてきたが、独自の生態系と多様な微生物叢が知られている。本研究では、干潟微生物が産生する生物活性物質を創薬に活用することを目的とした天然物ライブラリーの構築と、放線菌のメタボローム解析を活用した新奇二次代謝産物生産菌の探索研究を行っている。
【菌株の分離】熊本県沿岸部の干潟地帯で採取した土壌から、数種類の寒天培地を用いて菌の分離を行い、放線菌１５０株を単離した。干潟由来の菌株ライブラリーは合計５５０株となった。また、国内の土壌から放線菌２６０株を単離した。
【天然物ライブラリーの構築】独自に開発したシステム「培養―ブロス作製―成分分析のライン高速化システム」の運用に成功した。これにより一人が培養後に実質４時間の作業を行うことで、週に２プレート（９６穴、８０サンプル）のペースでブロスライブラリーを構築できるようになった。これまでに調整したサンプルは３，０００を超えるが、全て UPLC-HRMS で分析し成分の同定を行っている。既知の主要二次代謝産物は把握できているため、提供先のスクリーニングでヒットが出た際も迅速なデレプリケーション（既知化合物の排除）が可能となっている。
次年度の実施を計画している統計学的手法を活用した新奇化合物生産菌の探索研究の準備として、ワークステーションの選定を行い、データの変換や、解析に最適なソフトウエアの調査を行っている。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
当初の計画では令和元年度は微生物ブロスライブラリーを２，０００サンプル構築する計画であったが、３，０００サンプル以上のライブラリーを構築済みである。また、これらのUPLC-MS分析と成分の解析は終了している。
当初の計画通り、創薬スクリーニングへのサンプル供給は、プレートが調整され次第行っている。
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| 今後の研究の推進方策 |
令和元年度に確立した微生物ブロスライブラリーの拡充と、取得したUPLC-MSデータによるメタボローム解析を活用した新規化合物生産菌の発見を目指す。
ケミカルスクリーニングによるヒット化合物の単離精製と構造解析を行う。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
研究に必要なワークステーションが予想を上回る価格で他の物品購入を控えた結果、次年度使用額が生じた。
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