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2020 年度 実施状況報告書

早期大腸癌の簇出細胞に特有の後発遺伝子変異の同定

研究課題

研究課題/領域番号 19K07419
研究機関東京大学

研究代表者

立石 陽子  東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 講師 (20644438)

研究分担者 奥寺 康司  横浜市立大学, 医学部, 准教授 (10326027)
松村 舞依  横浜市立大学, 医学部, 助教 (50812997)
稲山 嘉明  横浜市立大学, 附属市民総合医療センター, 教授 (10184730)
大橋 健一  横浜市立大学, 医学研究科, 客員教授 (40231203)
研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
キーワード大腸癌 / リンパ節転移 / 簇出 / 全エクソンシークエンス
研究実績の概要

本研究の目的は、早期大腸癌の高悪性度成分と考えられる、浸潤部における簇出、低分化胞巣の形態を示す腫瘍細胞の遺伝子変異を明らかにすることである。大腸癌はひとつの腫瘍内でも多彩な組織像を示し、腺腫など前癌病変を背景として、粘膜内癌から粘膜下層に浸潤し、浸潤先進部では低分化な腫瘍胞巣や簇出が認められることが多い。浸潤先進部の低分化胞巣や簇出は、大腸癌のリンパ節転移のリスク因子として古くから知られている。我々は、病理組織標本の“簇出・低分化胞巣”という形態学的特徴に着目し、その分子基盤に迫るべく研究計画を立てた。
左半結腸に局在する大腸癌で、リンパ節転移を有し、浸潤部に簇出が目立つ2症例の凍結検体を用いて、正常粘膜、腫瘍、浸潤先進部の低分化胞巣をレーザーマイクロダイセクションで切り分け、DNAを抽出した。このDNAを用いて次世代シーケンサーによる全エクソンの網羅的遺伝子変異検索を行い、浸潤先進部の低分化胞巣成分に特有の候補遺伝子変異を同定した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

次世代シーケンサーによる全エクソンの網羅的遺伝子変異検索を行い、浸潤先進部の低分化胞巣成分に特有の候補遺伝子変異を同定した。しかしながら、研究分担者と研究機関が分かれており、テレワークなど行動の制限もあって研究をスムーズに進めることができず、候補遺伝子変異の同定に時間がかかってしまった。

今後の研究の推進方策

全エクソンの網羅的遺伝子変異検索により同定された、浸潤先進部の低分化胞巣成分に特有の候補遺伝子変異について、多数症例を用いて検証する予定である。

次年度使用額が生じた理由

全エクソンの網羅的遺伝子変異検索の解析を行ったが、浸潤先進部の低分化胞巣成分に特有の候補遺伝子変異の同定に時間がかかってしまい、多数例における検証が進まなかった。翌年度は検証を進めるための実験を精力的に行う予定である。

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公開日: 2021-12-27  

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