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2021 年度 実績報告書

精巣胚細胞腫瘍の分化調節に係るエピゲノム機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 19K07444
研究機関慶應義塾大学

研究代表者

新井 恵吏  慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 准教授 (40446547)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
キーワード精巣胚細胞腫瘍 / セミノーマ / DNAメチル化
研究実績の概要

精巣胚細胞腫瘍は始原生殖細胞を起源として発生する悪性腫瘍で、希少がんかつAYA (Adolescent and Young Adult)世代のがんである。正常発生・分化の諸段階を模倣する腫瘍内分化を示し、発生進展過程にはエピジェネティクスの寄与が示唆される。
ホルマリン固定パラフィン包埋標本からマイクロダイセクション技術を用いて精巣胚細胞腫瘍組織を組織亜型ごとに切り分け、イルミナ社Infinium BeadChipを用いてゲノム網羅的DNAメチル化解析を行った。主成分分析において、サンプルは組織亜型毎の分布を示した。セミノーマは同一組織亜型にも関わらず、胎児性癌に近いところに分布する症例 (Sem2)とそうでない症例(Sem1)の二群に分かれた。Sem1とSem2は形態学的な差が得られず、これらは分子生物学的に識別されるものと考えた。Sem2はSem1に比して有意にStageが進行しており、術後LDH・hCG・AFP値が有意に高かった。Sem2は悪性度が高く予後不良な胎児性癌に類似したDNAメチル化プロファイルを有することから、Sem1に比して予後不良であると予想される。
Sem1はゲノム網羅的低メチル化状態にあり、Sem2は一部の領域で高メチル化状態を示していた。Sem2はゲノム上の広い領域で高メチル化状態を示す胎児性癌に分化しつつあると考えられた。胎児性癌への分化に寄与しSem1とSem2で有意に異なるDNAメチル化プロファイルは、遺伝子コード領域でなく染色体安定性保持に重要である領域で先行して生じていた。一方で発現変化に帰結し得るDNAメチル化変化を示す遺伝子も同定し得た。これらの遺伝子のDNAメチル化の変化やmRNA・蛋白発現は、Sem1とSem2を識別し、腫瘍の悪性度評価や治療選択に繋がる診断マーカーとして有用であると考えられる。

  • 研究成果

    (14件)

すべて 2022 2021

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 1件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 3件、 招待講演 2件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] 肝発がんのエピゲノム・エピジェネティクス2022

    • 著者名/発表者名
      新井恵吏、藏本純子
    • 雑誌名

      病理と臨床

      巻: 40 ページ: 123-129

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Non-viral Induction of Transgene-free iPSCs from Somatic Fibroblasts of Multiple Mammalian Species2021

    • 著者名/発表者名
      Yoshimatsu S, Nakajima M, Iguchi A, Sanosaka T, Sato T, Nakamura M, Nakajima R, Arai E, Ishikawa M, Imaizumi K, Watanabe H, Okahara J, Noce T, Takeda Y, Sasaki E, Behr R, Edamura K, Shiozawa S, Okano H
    • 雑誌名

      Stem Cell Reports

      巻: 16 ページ: 754-770

    • DOI

      10.1016/j.stemcr.2021.03.002

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Clinicopathological impacts of DNA methylation alterations on pancreatic ductal adenocarcinoma: prediction of early recurrence based on genome-wide DNA methylation profiling2021

    • 著者名/発表者名
      Endo Y, Fujimoto M, Ito N, Takahashi Y, Kitago M, Gotoh M, Hiraoka N, Yoshida T, Kitagawa Y, Kanai Y, Arai E
    • 雑誌名

      J Cancer Res Clin Oncol

      巻: 147 ページ: 1341-1354

    • DOI

      10.1007/s00432-021-03541-6

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Evaluation of clinical formalin-fixed paraffin-embedded tissue quality for targeted-bisulfite sequencing2021

    • 著者名/発表者名
      Ohmomo H, Komaki S, Ono K, Sutoh Y, Hachiya T, Arai E, Fujimoto H, Yoshida T, Kanai Y, Sasaki M, Shimizu A
    • 雑誌名

      Pathol Int

      巻: 71 ページ: 135-140

    • DOI

      10.1111/pin.13054

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] DNA hypermethylation of the ZNF132 gene participates in the clinicopathological aggressiveness of 'pan-negative'-type lung adenocarcinomas2021

    • 著者名/発表者名
      Hamada K, Tian Y, Fujimoto M, Takahashi Y, Kohno T, Tsuta K, Watanabe S, Yoshida T, Asamura H, Kanai Y, Arai E
    • 雑誌名

      Carcinogenesis

      巻: 42 ページ: 169-179

    • DOI

      10.1093/carcin/bgaa115

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 精巣2021

    • 著者名/発表者名
      新井恵吏
    • 雑誌名

      病理と臨床第39巻臨時増刊号 治療方針を変える病理所見

      巻: 39 ページ: 249-258

    • 査読あり
  • [学会発表] Quantification of DNA methylation for carcinogenic risk estimation in patients with non-alcoholic steatohepatitis2022

    • 著者名/発表者名
      Kuramoto J, Arai E, Fujimoto M, Tian Y, Yamada Y, Yotani T, Makiuchi S, Tsuda N, Ojima H, Fukai M, Seki Y, Kasama K, Funahashi N, Udagawa H, Nammo T, Yasuda K, Taketomi A, Kanto T, Kanai Y
    • 学会等名
      American Association of Cancer Research Annual Meeting 2022
    • 国際学会
  • [学会発表] Cancer-specific glycosylation regulated by epigenomic alteration in renal cell carcinoma2022

    • 著者名/発表者名
      Kitazume Y, Arai E, Matsuda A, Kakuda S, Ohara K, Maeshima AM, Yoshida T, Kuno A, Kanai Y
    • 学会等名
      American Association of Cancer Research Annual Meeting 2022
    • 国際学会
  • [学会発表] Correlations between genome-wide DNA methylation profiles and genomic driver aberrations during multistage lung adenocarcinogenesis2021

    • 著者名/発表者名
      Hamada K, Tian Y, Fujimoto M, Takahashi Y, Kohno T, Tsuta K, Watanabe S, Yoshida T, Asamura H, Kanai Y, Arai E
    • 学会等名
      American Association of Cancer Research Annual Meeting 2021
    • 国際学会
  • [学会発表] うつ病症例の血液検体におけるDNAメチル化異常2021

    • 著者名/発表者名
      長尾幸子、新井恵吏、田迎、藤本真央、亀山真一、高橋順子、服部功太郎、功刀浩、金井弥栄
    • 学会等名
      第110回日本病理学会総会
  • [学会発表] エピゲノムを基盤とした分子病理診断による患者の層別化と個別化医療2021

    • 著者名/発表者名
      新井恵吏
    • 学会等名
      第110回日本病理学会総会
    • 招待講演
  • [学会発表] Alteration of protein glycosylation in renal carcinogenesis2021

    • 著者名/発表者名
      Kitazume Y, Arai E, Matsuda A, Kakuda S, Ohara K, Maeshima AM, Yoshida T, Kuno A, Kanai Y
    • 学会等名
      第80回日本癌学会学術総会
  • [学会発表] Personalized medicine development based on pathology2021

    • 著者名/発表者名
      Arai E
    • 学会等名
      第80回日本癌学会学術総会
    • 招待講演
  • [産業財産権] 腎がんを診断する又は検出するための方法及びキット2021

    • 発明者名
      久野 敦・梶 裕之・金井 弥栄・新井 恵吏・北爪 賀子他
    • 権利者名
      久野 敦・梶 裕之・金井 弥栄・新井 恵吏・北爪 賀子他
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      特願2021-171950

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公開日: 2022-12-28  

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