HIV-1Vif/HDAC3複合体によるHIV-1潜伏感染転写ネットワークの制御

2019 年度 実施状況報告書

• 研究課題/領域番号: 19K07591
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 白川 康太郎 京都大学, 医学研究科, 助教 (80728270)
• 研究期間 (年度): 2019-04-01 – 2022-03-31
• キーワード: HIV-1 / 潜伏感染 / CAGE法 / CRISPRスクリーニング

研究実績の概要

HIVGKOを感染させたJurkatT細胞モデルを用いて潜伏感染細胞の遺伝子発現プロファイルをCAGE法により解析した。非感染細胞に比較して潜伏感染細胞で31種の遺伝子発現の低下を同定したが、遺伝子発現が増加した遺伝子は認めなかった。これらの遺伝子のうち非感染細胞でSPP1とAPOEが増加していたことは、そのノックダウンにより感染細胞が低下することから、これらの遺伝子発現がHIV-1感染に抑制性に機能していることを示唆している。
またこの潜伏感染細胞モデルを用いてCRISPRスクリーニングを行い、潜伏感染の再活性化に関わる遺伝子群を同定した。

現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

予定した潜伏感染細胞で特異的に遺伝子発現の変化があった遺伝子の機能について解明できた。CRISPRスクリーニングの予備実験が終了し、潜伏感染再活性化における遺伝子群を同定できているため。

今後の研究の推進方策

CRISPRスクリーニングで同定した遺伝子群の機能解析を行う。

次年度使用額が生じた理由

次年度の試薬代に使用します。

研究成果

• [国際共同研究] Buck Institute for Research on Aging(米国)
  • 国名: 米国
  • 外国機関名: Buck Institute for Research on Aging
• [学会発表] HIV-1 latent infection does not trigger cellular transcriptional responses in T-cells (2020)
  • 著者名/発表者名: Hiroyuki Matsui, Kotaro Shirakawa, Shigeki Hirabayashi, Anamaria D. Sarca, Hirofumi Fukuda, Yasuhiro Murakawa, Emilie Battivelli, Eric Verdin, Akifumi Takaori-Kondo
  • 学会等名: Keystone Symposia 2020 HIV Pathogenesis and Cure X6
  • 国際学会
• [備考] Verdin Lab website
  • URL: https://www.buckinstitute.org/lab/verdin-lab/