研究課題
癌転移は、癌患者の死の主要な原因である。癌の発生原因を標的とした治療薬は開発されている一方で、これまで転移を標的とした癌の治療法は開発されていない。その原因の一つは、癌転移の分子機構が解明されていない点にある。そこで、申請者らは、これまでにスキルス胃がんの細胞モデルを用いて、癌転移の分子機構の解析を進めてきた。その研究の中で、新たにRNAのメチル化酵素METTL3の発現が転移能獲得に伴って上昇することを見出した。METTL3は、細胞内で最も豊富に存在するRNA修飾であるm6Aの生成に関わることが知られる。そこで、高転移能を有するスキルス胃がんの細胞モデルで、METTL3の発現を低下させたところ、細胞内のm6Aレベルが低下すると共に、細胞の遊走能が大きく低下することを見出した。これら結果は、m6Aが癌転移において重要な役割を果たしていることを示唆している。そこで、癌転移におけるm6Aの役割を明らかにするため、まず高転移能を有するスキルス胃がんの細胞モデルにおけるm6Aの存在箇所についてゲノムワイドな探索を試みた。具体的には、断片化したmRNAに対して、抗m6A抗体を用いた免疫沈降を行い、そのサンプルを次世代シークエンサーで解析を計画した。この過程において、mRNAの断片化や次世代シークエンサー解析のためのアダプター付加について、条件検討を行った。その後、次世代シークエンサーにより抗m6A抗体を用いた免疫沈降サンプルの解析まで行った。研究実施計画通りに、初年度は次世代シークエンサーによるデータ取得まで終了した。
2: おおむね順調に進展している
研究計画通り、スキルス胃がんの転移細胞モデルからMETTL3ノックダウン細胞株の樹立とその機能解析を行った。また、これら細胞株を用いて、RNA免疫沈降サンプルからシークエンサーによる解析までを終了した。初年度の研究計画全てを順調に達成した。
初年度の研究実施計画で取得した次世代シークエンサーの結果について、情報解析から2年目の研究を開始する。情報解析の手法は、日々更新されているので、複数の方法による解析を試みて、その結果について個別に検証を進めていく予定である。
次世代シークエンサーによる解析が、受託解析となった一方で、コロナウイルス 蔓延の影響で解析の迅速化オプションが無効となり、解析費用に差額が生じた。しかし、この費用を、次年度の初年度に得られた結果の検証に回し、検証サンプルを増やすことで、研究結果をより高い精度で検証することを計画している。
すべて 2019
すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (1件)
Scientific Reports
巻: 9 ページ: 10591
10.1038/s41598-019-47033-7.
