| 研究課題/領域番号 |
19K08310
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| 研究機関 | 埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所) |
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研究代表者 |
川村 眞智子 埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所), 病院 血液内科, 副部長 (80450592)
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| 研究分担者 |
金子 安比古 埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所), 臨床腫瘍研究所, その他 (50373387)
小林 泰文 埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所), 病院 血液内科, 副病院長 (50455375)
春田 雅之 埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所), 臨床腫瘍研究所, 研究員 (80392190)
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| 研究期間 (年度) |
2019-04-01 – 2023-03-31
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| キーワード | 白血病 / クロモスリプシス / SNPアレイ / PNA-FISH / double minute / 次世代シークエンス |
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| 研究実績の概要 |
目的：クロモスリプシスが関わるがんは難治であり、発症機序は未だ不明である。全ゲノムシークエンス(WGS)で難治性白血病にクロモスリプシスを検出し、クロモスリプシス関連白血病の細胞形態、染色体、遺伝子レベルでの特徴を明らかにするとともに、WGSによらない同白血病のスクリーニング法を開発する。
方法：①クロモスリプシス（染色体破砕；chromothripsis）は近年、次世代シークエンス(NGS)によって発見された発がん機構で、難治性白血病にみられるがその発症機序は不明である。②クロモスリプシス関連白血病検体において、ゲノム損傷修復遺伝子、細胞分裂時の染色体分配に関わる遺伝子の異常を中心に網羅的解析を行い、関連を明らかにする。③クロモスリプシスを示唆する細胞小核を持つ白血病を対象に、FISH、Peptidenucleicacid (PNA)-FISH，SNP array (CNV解析)、核型を分析し、NGS (全ゲノムシークエンス、RNAシークエンス) の結果と照合し、クロモスリプシス関連白血病の診断法を開発する。
結果：71症例の白血病（ALL, MDS/AML）に関してSNP arrayを行った。PNA-FISHを27症例で、Ion Torrent Oncomine Myeloid Research Assayを16例で解析した。RNA-シークエンスを12例、全ゲノムシークエンスを4例で行った。SNP arrayからクロモスリプシス様パターンを示す11例を選択した。3例は、核型分析でdouble minutes、17番染色体異常を呈し、SNP arrayでMYCを含む8q24.13-8q24.21の増幅、TP53遺伝子変異が共通していた。他の9例は、既報のiAMP21のALL、新規NUP98関連二次性AML、新規BCL11B関連T-ALL等を確認している。さらなる解析中である。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
新型コロナウイルスの拡大により、通勤を制限された期間がであった。
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| 今後の研究の推進方策 |
現在これまでのデータをまとめて、不足している解析を行いながら、論文作成を行っている。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
新型コロナのため、国内・国際学会などの旅費が不用だったため若干の余剰がありました。
最終年度に、投稿料などに必要になる予定です。
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