研究課題/領域番号 |
19K08367
|
研究機関 | 金沢大学 |
研究代表者 |
太田 亮介 金沢大学, がん進展制御研究所, 研究協力員 (40767935)
|
研究分担者 |
源 利成 金沢大学, がん進展制御研究所, 教授 (50239323)
澤田 武 名古屋市立大学, 医薬学総合研究院(医学), 研究員 (60345626)
山本 英一郎 札幌医科大学, 医学部, 講師 (60567915)
佐々木 泰史 札幌医科大学, 医療人育成センター, 教授 (70322328)
|
研究期間 (年度) |
2019-04-01 – 2022-03-31
|
キーワード | 大腸癌 |
研究実績の概要 |
本研究の目的は、遺伝子発現プロファイルの解析と融合遺伝子の探索により、大腸鋸歯状腺腫(traditional serrated adenoma, TSA)を前癌病変とする発癌経路の確立と、その分子機構の解明を行うことである。 具体的には、TSAの遺伝子発現プロファイルを、従来報告されている予後不良の高悪性度進行癌の発現プロファイルと比較、また他の鋸歯状病変である無茎性鋸歯状病変(sessile serrated lesion, SSL)のプロファイルを比較することにより、TSAの発癌経路を確立する。加えて、TSAに特異的な遺伝子発現の変化や融合遺伝子を同定し、新たな発癌機構を解明する。また、同定された遺伝子発現の変化や融合遺伝子の有無と早期病変、進行癌における臨床病理学的特徴との関連を検討する。 研究実施計画では、BRAF遺伝子変異を伴うTSA、KRAS遺伝子変異を伴うTSA、SSLをそれぞれ5病変ずつ、計15病変の集積を目標としていた。その後、採取された検体から核酸(DNA, RNA)を抽出し、そのDNAを用いて変異(KRAS/BRAF)とメチル化(CIMP)によるプロファイリングを、前もって行う予定であった。その後、同15病変と(対照となる)大腸正常粘膜5検体、合計20検体から抽出したRNAを用いて、RNAシーケンス解析を行う予定としていた。 当該年度においては解析に用いる臨床検体の集積を継続して行った。また、多数検体を用いて遺伝子変異、遺伝子発現による検証を行う予定としていたが、それらの集積とDNA抽出、変異の解析を行った。
|
現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
4: 遅れている
理由
BRAF遺伝子変異を伴う大腸鋸歯状腺腫(TSA)、KRAS遺伝子変異を伴うTSA、無茎性鋸歯状病変(SSL)各5病変ずつと、正常粘膜5検体の合計20検体を用いて、RNAシーケンスを行う予定としているが、TSAはまれな病変であり、集積が遅れているため。
|
今後の研究の推進方策 |
今後、症例の集積をさらに進める。また、検証に用いる、従来切除されホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)されている検体の集積は進んでいるため、RNAを用いた解析が難しいようであれば、DNAによるプロファイリングが可能かどうかも検討する。
|
次年度使用額が生じた理由 |
当初予定していた学会出張などがなくなったため。次年度分と合わせ、シーケンス解析に用いる予定である。
|