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2021 年度 実績報告書

胃がんにおけるCIMP誘発メカニズムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 19K08456
研究機関国立研究開発法人国立がん研究センター

研究代表者

山田 晴美  国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 研究員 (10769425)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
キーワードCpGアイランドメチル化形質 / 胃がん / ARID1A / SWI/SNF
研究実績の概要

胃がんなどの炎症関連がんにおいては、多数の遺伝子がメチル化されている状態、即ち、CpGアイランドメチル化形質(CIMP)は、予後や治療効果と関連することが知られている。一方で、その形成メカニズムは十分に解明されていない。申請者は、EBV感染のない胃がんの変異解析およびメチル化解析から、クロマチンリモデリング複合体SWI/SNFの構成因子であるARID1A変異をもつ胃がんはCIMPを示すことを予備的に見出している。そこで本研究では、ゲノム編集によりARID1Aを不活化することで、CIMP(異常メチル化)が誘発されるかどうかを明らかにする。さらにその分子メカニズムを、遺伝子のメチル化感受性の変化およびメチル化調節因子の変化に着目して解明する。
3年目の本年度は、これまでの解析に使用していた293FT細胞に加え、胃正常上皮細胞GES1でもARID1Aノックアウトによりメチル化異常が誘発されるかを検討した。GES1親クローン1株、野生型(WT)クローン3株およびKOクローン3株につき、培養開始後0、4週時点でゲノム網羅的メチル化解析を行った。その結果、ARID1A KOクローンでは、0週時点で、7,167領域でメチル化レベルが上昇(Δβ>0.2)した。しかし、期間依存的なメチル化領域の増加は認めなかった。これは、GES1は正常細胞であるが、メチル化領域が多いがん細胞に近いメチル化パターンを有しているためと考えられた。
1-3年目までの成果より、ARID1Aの機能欠失がCIMPを誘発することが示唆された。

  • 研究成果

    (3件)

すべて 2022 2021

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] ARID1A loss-of-function induces CpG island methylator phenotype2022

    • 著者名/発表者名
      Yamada Harumi、Takeshima Hideyuki、Fujiki Ryoji、Yamashita Satoshi、Sekine Shigeki、Ando Takayuki、Hattori Naoko、Okabe Atsushi、Yoshikawa Takaki、Obama Kazutaka、Katai Hitoshi、Kaneda Atsushi、Ushijima Toshikazu
    • 雑誌名

      Cancer Letters

      巻: 532 ページ: 215587~215587

    • DOI

      10.1016/j.canlet.2022.215587

    • 査読あり
  • [学会発表] ARID1A loss-of-function induces the CpG island methylator phenotype2021

    • 著者名/発表者名
      Harumi Yamada
    • 学会等名
      第80回日本癌学会学術総会
  • [学会発表] ARID1A loss-of-function induces the CpG island methylator phenotype2021

    • 著者名/発表者名
      Harumi Yamada
    • 学会等名
      第32回日本消化器癌発生学会総会・第10回国際消化器癌発生会議

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公開日: 2022-12-28  

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