網羅的遺伝子解析技術を用いた家族性高コレステロール血症の遺伝子診断

2019 年度 実施状況報告書

• 研究課題/領域番号: 19K08553
• 研究機関: 金沢大学
• 研究代表者: 川尻 剛照 金沢大学, 医学系, 准教授 (90345637)
• 研究分担者: 下島 正也 金沢大学, 附属病院, 特任助教 (00613754) ; 多田 隼人 金沢大学, 附属病院, 助教 (90623653)
• 研究期間 (年度): 2019-04-01 – 2022-03-31
• キーワード: 家族性高コレステロール血症 / 網羅的遺伝子解析 / 遺伝子多型

研究実績の概要

家族性高コレステロール血症は、かつて低比重リポ蛋白受容体遺伝子変異を主な原因とする単純な優性遺伝性疾患と考えられていた。しかしながら、臨床的に家族性高コレステロール血症と診断される症例の1/3～1/4の原因遺伝子を同定できないことが知られている。近年、効果量の小さいさまざまな遺伝子変異・多型が一個人に重複した「多遺伝子家族性高コレステロール血症」の概念が浸透してきた。
検索の範囲で、「多遺伝子家族性高コレステロール血症」に関する研究は本邦で行われていない。そこで、わが国における「多遺伝子家族性高コレステロール血症」を効率的に拾い上げるため、まず、臨床的にFHと診断された552名を対象に、ジェノタイピングを行った。遺伝子解析は、金沢大学で確立した「脂質代謝に関連する遺伝子の網羅的解析」スキーム（HaloPlexターゲットエンリッチメントシステムによりキャプチャし、解析は卓上型次世代シーケンサーを用いる）を用いた。同定された遺伝子変異はSanger法で確認を行った。大規模欠損の同定には、Multiplex Ligation Probe Amplification（MLPA）法を用いた。
候補遺伝子の絞り込みは、エクソーム隠れマルコフモデル（XHMM）ソフトウエアを用いたin silico解析、MLPA法で検証した。BioBank Japanの公開データを利用し、臨床的に診断された家族性高コレステロール血症それぞれのLDL-Cに対する多遺伝子リスクスコアを計算した。

現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

金沢大学で確立した「脂質代謝に関連する遺伝子の網羅的解析」スキーム（HaloPlexターゲットエンリッチメントシステムによりキャプチャし、解析は卓上型次世代シーケンサーを用いる）により臨床的に家族性高コレステロール血症と診断された552名に対し、ジェノタイピングを行った。候補遺伝子の絞り込みは、エクソーム隠れマルコフモデル（XHMM）ソフトウエアを用いたin silico解析、Multiplex Ligation Probe Amplification（MLPA）法で検証した。
その後、DDBJに公開データとして登録されているBioBank Japan約20万人分の日本人ゲノムデータを用いたLDLコレステロールを表現型としてゲノムワイド関連解析の結果を参考に、ジェノタイピングを行った臨床的家族性高コレステロール血症それぞれの多遺伝子リスクスコアを計算した。
これらの進捗状況は当初の計画通りであり、おおむね順調に進展していると判断している。

今後の研究の推進方策

次年度は、当初予定になかった本計算結果をコントロールデータとして使用する石川県金沢市志賀町のゲノムコホート約1000名と統合し、Polygenic FHの探索をすすめる。
抽出されたPlygenic FH候補症例から末梢血T細胞からiPS細胞を樹立し、iPS細胞由来肝細胞の作成を目標とする。

次年度使用額が生じた理由

来年度以降の細胞実験に多くの消耗品が必要と見込まれる。今年度は、遺伝子解析は日本循環器学会等から獲得した類似の研究費で賄い、敢えて余剰金を作った。

研究成果

• [雑誌論文] Impact of Renin-Angiotensin System Blockade on the Prognosis of Acute Coronary Syndrome Based on Left Ventricular Ejection Fraction (2020)
  • 著者名/発表者名: Raposeiras-Roubn S, Kawashiri M, et al.
  • 雑誌名: Rev Esp Cardiol (Engl Ed) 巻: 73 ページ: 114-122
  • DOI: 10.1016/j.rec.2019.02.012.
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Clinical Impact of Carotid Plaque Score Rather Than Carotid Intima-Media Thickness on Recurrence of Atherosclerotic Cardiovascular Disease Events (2020)
  • 著者名/発表者名: Tada H, Nakagawa T, Okada H, Nakahashi T, Mori M, Sakata K, Nohara A, Takamura M, Kawashiri MA.
  • 雑誌名: J Atheroscler Thromb 巻: 27 ページ: 38-46
  • DOI: 10.5551/jat.49551
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] P2Y12 Inhibitors in Acute Coronary Syndrome Patients With Renal Dysfunction: An Analysis From the RENAMI and BleeMACS Projects (2020)
  • 著者名/発表者名: De Filippo O, Kawashiri M, et al.
  • 雑誌名: Eur Heart J Cardiovasc Pharmacother 巻: 6 ページ: 31-42
  • DOI: 10.1093/ehjcvp/pvz048.
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Average Daily Ischemic Versus Bleeding Risk in Patients With ACS Undergoing PCI: Insights From the BleeMACS and RENAMI Registries (2020)
  • 著者名/発表者名: D'Ascenzo F, Kawashiri M, et al.
  • 雑誌名: Am Heart J 巻: 220 ページ: 108-115
  • DOI: 10.1016/j.ahj.2019.10.001.
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Beneficial Effect of Ezetimibe-Atorvastatin Combination Therapy in Patients With a Mutation in ABCG5 or ABCG8 Gene (2020)
  • 著者名/発表者名: Tada H, Okada H, Nomura A, Takamura M, Kawashiri MA.
  • 雑誌名: Lipids Health Dis 巻: 19 ページ: 3
  • DOI: 10.1186/s12944-019-1183-4.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Fasting and Non-Fasting Triglycerides and Risk of Cardiovascular Events in Diabetic Patients Under Statin Therapy (2020)
  • 著者名/発表者名: Tada H, Nomura A, Yoshimura K, Itoh H, Komuro I, Yamagishi M, Takamura M, Kawashiri MA.
  • 雑誌名: Circ J 巻: 84 ページ: 509-515
  • DOI: 10.1253/circj.CJ-19-0981.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Takotsubo Cardiomyopathy Complicated by Cardiac Tamponade Due to Non-Hemorrhagic Pericardial Effusion: A Case Report (2020)
  • 著者名/発表者名: Nagamori Y, Hamaoka T, Murai H, Takashima S, Kato T, Usui S, Sakata K, Furusho H, Kawashiri M, Takamura M.
  • 雑誌名: BMC Cardiovasc Disord 巻: 20 ページ: 67
  • DOI: 10.1186/s12872-020-01377-5.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Impact of Cardiac Myosin Light Chain Kinase Gene Mutation on Development of Dilated Cardiomyopathy (2019)
  • 著者名/発表者名: Hodatsu A, Fujino N, Uyama Y, Tsukamoto O, Imai-Okazaki A, Yamazaki S, Seguchi O, Konno T, Hayashi K, Kawashiri MA, Asano Y, Kitakaze M, Takashima S, Yamagishi M.
  • 雑誌名: ESC Heart Fail 巻: 6 ページ: 406-415
  • DOI: 10.1002/ehf2.12410
  • 査読あり
• [雑誌論文] Impact of Decreased Ankle-Brachial Index on 30-day Bleeding Complications and Long-Term Mortality in Patients With Acute Coronary Syndrome After Percutaneous Coronary Intervention (2019)
  • 著者名/発表者名: Nakahashi T, Tada H, Sakata K, Yakuta Y, Tanaka Y, Gamou T, Nomura A, Terai H, Horita Y, Ikeda M, Namura M, Takamura M, Hayashi K, Yamagishi M, Kawashiri MA.
  • 雑誌名: J Cardiol 巻: 74 ページ: 116-122
  • DOI: 10.1016/j.jjcc.2019.01.008
  • 査読あり
• [雑誌論文] C-Peptide Area Under the Curve at Glucagon Stimulation Test Predicts Glucose Improvements by GLP-1 Receptor Analogue: A Retrospective Observational Study (2019)
  • 著者名/発表者名: Ohbatake A, Yagi K, Karashima S, Shima Y, Miyamoto Y, Asaka H, Okazaki S, Kometani M, Kawashiri MA, Takeda Y, Yoneda T, Chujo D.
  • 雑誌名: Diabetes Ther 巻: 10 ページ: 673-681
  • DOI: 10.1007/s13300-019-0586-6
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Rare Protein-Truncating Variants in APOB, Lower Low-Density Lipoprotein Cholesterol, and Protection Against Coronary Heart Disease (2019)
  • 著者名/発表者名: Peloso GM, Nomura A, Khera AV, Chaffin M, Won HH, Ardissino D, Danesh J, Schunkert H, Wilson JG, Samani N, Erdmann J, McPherson R, Watkins H, Saleheen D, McCarthy S, Teslovich TM, Leader JB, Lester Kirchner H, Marrugat J, Nohara A, Kawashiri MA, Tada H, Dewey FE, Carey DJ, Baras A, Kathiresan S.
  • 雑誌名: Circ Genom Precis Med 巻: 12 ページ: e002376
  • DOI: 10.1161/CIRCGEN.118.002376.
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Lipoprotein(a) as an Old and New Causal Risk Factor of Atherosclerotic Cardiovascular Disease (2019)
  • 著者名/発表者名: Tada H, Takamura M, Kawashiri MA.
  • 雑誌名: J Atheroscler Thromb 巻: 26 ページ: 583-591
  • DOI: 10.5551/jat.RV17034.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Unusual Aorto-mitral Discontinuity Caused by Infective Endocarditis (2019)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa T, Mori M, Tada H, Ohira M, Iino K, Hayashi K, Takemura H, Yamagishi M, Kawashiri MA.
  • 雑誌名: Intern Med . 巻: 58 ページ: 2373-2376
  • DOI: 10.2169/internalmedicine.2629-19.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Monogenic, Polygenic, and Oligogenic Familial Hypercholesterolemia (2019)
  • 著者名/発表者名: Tada H, Nohara A, Kawashiri MA.
  • 雑誌名: Curr Opin Lipidol 巻: 30 ページ: 300-306
  • DOI: 10.1097/QCO.0000000000000563.
• [雑誌論文] The First Report of Purulent Pericarditis Associated With Aortic Stent-graft Infection Caused by Methicillin-susceptible Staphylococcus Aureus (2019)
  • 著者名/発表者名: Yamagami K, Tanaka Y, Tada H, Fujii H, Takamura M, Kawashiri MA.
  • 雑誌名: Intern Med 巻: 58 ページ: 3103-3106
  • DOI: 10.2169/internalmedicine.2994-19.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Acute Myocardial Infarction in a Patient Positive for Lupus Anticoagulant: A Case Report (2019)
  • 著者名/発表者名: Murai K, Sakata K, Gamou T, Nagata Y, Tada H, Shimojima M, Okada H, Hayashi K, Kawashiri MA.
  • 雑誌名: BMC Cardiovasc Disord 巻: 19 ページ: 167
  • DOI: 10.1186/s12872-019-1153-9.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Rare and Deleterious Mutations in ABCG5/ABCG8 Genes Contribute to Mimicking and Worsening of Familial Hypercholesterolemia Phenotype (2019)
  • 著者名/発表者名: Tada H, Okada H, Nomura A, Yashiro S, Nohara A, Ishigaki Y, Takamura M, Kawashiri MA.
  • 雑誌名: Circ J 巻: 83 ページ: 1917-1924
  • DOI: 10.1253/circj.CJ-19-0317.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Primary Aldosteronism Subtype Discordance Between Computed Tomography and Adrenal Venous Sampling (2019)
  • 著者名/発表者名: Aono D, Kometani M, Karashima S, Usukura M, Gondo Y, Hashimoto A, Demura M, Furukawa K, Takeda Y, Kawashiri M, Yoneda T.
  • 雑誌名: Hypertens Res 巻: 42 ページ: 1942-1950
  • DOI: 10.1038/s41440-019-0310-y.
  • 査読あり
• [学会発表] 家族性高コレステロール血症の諸問題 新しい治療の選択に関わる諸問題、ビジョン (2019)
  • 著者名/発表者名: 川尻剛照
  • 学会等名: 第51回日本動脈硬化学会総会・学術集会
  • 招待講演
• [学会発表] 遺伝性疾患と遺伝学に学ぶ脂質治療 (2019)
  • 著者名/発表者名: 川尻剛照
  • 学会等名: 第67回日本心臓病学会学術集会
  • 招待講演