研究課題/領域番号 |
19K08566
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
審査区分 |
小区分53020:循環器内科学関連
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研究機関 | 日本医科大学 |
研究代表者 |
村田 広茂 日本医科大学, 医学部, 助教 (30594014)
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研究分担者 |
大野 聖子 国立研究開発法人国立循環器病研究センター, 研究所, 部長 (20610025)
清水 渉 日本医科大学, 大学院医学研究科, 大学院教授 (50399606)
堀江 稔 滋賀医科大学, アジア疫学研究センター, 特任教授 (90183938)
相庭 武司 国立研究開発法人国立循環器病研究センター, 研究所, 部長 (40574348)
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研究期間 (年度) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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キーワード | 遺伝性不整脈 / 心臓突然死 / ゲノム解析 / バイオインフォマティクス / エピジェネティクス |
研究成果の概要 |
洞不全を合併する突然死家系の全ゲノム解析を施行した。結果、表現型との強い連鎖を認めた染色体4q25の領域に15 kbps長のヘテロ接合性欠失を検出した。エピジェネティクスデータベースを用いてバイオインフォマティクス解析した結果、転写因子CTCFが構築するクロマチンループの傷害が転写因子PITX2の発現異常を生じることが推定された。患者iPS細胞由来心筋と欠失導入マウスを用いた実験によりPITX2の発現異常と洞不全が証明された。これまで機能不明と考えられてきた非コード領域の欠失が遺伝性突然死症候群の原因となることを証明することが可能であった。
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自由記述の分野 |
循環器内科学関連
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研究成果の学術的意義や社会的意義 |
本研究は、ヒストン修飾情報、転写因子結合部位(シストローム)、ゲノム構造化解析を含むエピジェネティクス・データベースを用いた包括的バイオインフォマティクス技術により、遺伝性不整脈疾患の全ゲノムシークエンスデータからタンパク・アミノ酸に翻訳されるコードDNA領域のみならず非コードDNA領域に局在する調節因子の異常を検出することで、遺伝性不整脈疾患の新規発症機序を解明した初めての研究である。本解析法を用いることで全ゲノムシークエンスの真の利点を生かすことが可能となる。
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