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2020 年度 実施状況報告書

ゲノミクスを用いた感染性心内膜炎の新規診断法の検討

研究課題

研究課題/領域番号 19K08591
研究機関帝京大学

研究代表者

片岡 明久  帝京大学, 医学部, 講師 (70758143)

研究分担者 片桐 さやか  東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 助教 (60510352)
芝 多佳彦  東京医科歯科大学, 歯学部, 非常勤講師 (90802306)
研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
キーワード感染性心内膜炎 / 口腔内細菌 / バイオインフォマティクス / 細菌学 / 遺伝学
研究実績の概要

2019年度、2020年度で回収できた試料を医科歯科大学に移送して細菌のDNAを抽出し、16S rRNA gene(V3-V4)をターゲットとしたプライマーを用いてライブラリーを作製後、次世代シークエンサー(Illumina Miseq)でシーケンス解析を行った。

また、リアルタイムPCR法により総菌数、各細菌数の対総菌比率を算出し、血清試料からは全菌体に対するIgGおよびIgGサブクラス血清抗体価をELISA法にて測定を行った。

現在その解析結果を考察中であり、まだ十分な症例数がないため、まずCase reportとして、報告をする準備中である。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

COVID-19に感染拡大伴い、発熱症例の診療フローが変わったために、帝京大学病院での感染性心膜炎入院患者が激減した。
また緊急事態宣言により、研究室の一時閉鎖などもあり、症例登録、実験解析行程に遅れが生じでしまった。

今後の研究の推進方策

COVID-19に感染拡大伴う発熱症例の診療フローは、もとに戻らないと考えているため、今後十分な症例登録は当初の想定期間内には達成できない可能性が生じてきた。
研究実施期間の延長や、関連病院などに声をかけ、多施設での試験に切り替えるなど、対策を検討していく。

次年度使用額が生じた理由

COVID-19パンデミックに伴い、症例登録数が想定以下だった為、解析回数が少なく費用のすべてを予定通り使用できなかった。

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公開日: 2021-12-27  

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