C. difficileのクオラムセンシング機構に関する分子疫学と機能解明の研究

2020 年度 実施状況報告書

• 研究課題/領域番号: 19K08949
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 奥川 周 東京大学, 医学部附属病院, 准教授 (20376461)
• 研究期間 (年度): 2019-04-01 – 2022-03-31
• キーワード: C. difficile / agr遺伝子 / CRISPR-Cas9

研究実績の概要

2020年度は2019年度から解析を行っているC. difficileの臨床分離株を用いたagr遺伝子の分子疫学的多様性に関する成果を国際学会や学術誌で報告した。さらにagr遺伝子の機能解明をすすめるため、2020年度よりagr遺伝子欠損株の作成に着手した。C. difficileのゲノム編集には、近年報告されたPolar effectを受けにくいCRISPR-Cas9システムを用いることとした。2020年度にプラスミドベクターの構築を終え、引き続き変異株を作成中である。今後は毒素産生株および非毒素産生株のagr遺伝子の変異株を用い、微生物学的な表現型の検討を行いagr遺伝子の機能解明を行う。

現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

新型コロナウイルス流行に伴う非常事態宣言のため、研究を十分に行えない期間があったためやや計画より遅れている。

今後の研究の推進方策

遺伝子変異株とともに臨床分離株を用いagr遺伝子の機能解明と多様性との関連を検証する。

研究成果

• [雑誌論文] Genetic diversity and epidemiology of accessory gene regulator loci in Clostridioides difficile (2020)
  • 著者名/発表者名: Yuta Okada, Shu Okugawa, Mahoko Ikeda, Tatsuya Kobayashi, Ryoichi Saito, Yoshimi Higurashi, Kyoji Moriya
  • 雑誌名: Access Microbiology 巻: (2)7 ページ: acmi000134
  • DOI: 10.1099/acmi.0.000134.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Impact of deoxycholate on Clostridioides difficile growth, toxin production, and sporulation (2020)
  • 著者名/発表者名: Usui Y, Ayibieke A, Kamiichi Y, Okugawa S, Moriya K, Tohda S, Saito R.
  • 雑誌名: Heliyon 巻: 6(4) ページ: e03717
  • DOI: 10.1016/j.heliyon.2020.e03717.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Microbiological analysis of infectious lymphocele: Case series and literature review. (2020)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto S, Ikeda M, Kanno Y, Okamoto K, Okugawa S, Moriya K.
  • 雑誌名: J Infect Chemother. 巻: 27(2) ページ: 172-178
  • DOI: 10.1016/j.jiac.2020.08.021.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] First Reported Human Case of Spondylodiscitis by Staphylococcus condimenti: A Case Report and Literature Review. (2020)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi T, Nakajima K, Oshima Y, Ikeda M, Kitaura S, Ikeuchi K, Okamoto K, Okada Y, Ohama Y, Higurashi Y, Okugawa S, Moriya K.
  • 雑誌名: Intern Med. 巻: 60(4) ページ: 635-637
  • DOI: 10.2169/internalmedicine.5180-20.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Acute Pancreatitis During COVID-19 Pneumonia. (2020)
  • 著者名/発表者名: Shinohara T, Otani A, Yamashita M, Wakimoto Y, Jubishi D, Okamoto K, Kanno Y, Ikeda M, Ishigaki K, Nakai Y, Harada S, Okugawa S, Koike K, Moriya K.
  • 雑誌名: Pancreas 巻: 49(10) ページ: e106-e108
  • DOI: 10.1097/MPA.0000000000001695.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Vibrio fluvialis Liver Abscess and Bacteremia in a Sashimi Lover: A Case Report and Review of the Literature. (2020)
  • 著者名/発表者名: Kitaura S, Okamoto K, Wakabayashi Y, Okada Y, Okazaki A, Ikeda M, Hakuta R, Nakai Y, Okugawa S, Koike K, Moriya K.
  • 雑誌名: Open Forum Infect Dis. 巻: 7(6) ページ: ofaa212
  • DOI: 10.1093/ofid/ofaa212.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] Genetic Diversity and Epidemiology of Accessory Gene Regulator Loci in the Clinical Isolates of Clostridioides Difficile (2020)
  • 著者名/発表者名: Yuta Okada, Shu Okugawa, Mahoko Ikeda, Tatsuya Kobayashi, Ryoichi Saito, Yoshimi Higurashi, Kyoji Moriya
  • 学会等名: ASM microbe 2020
  • 国際学会