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本研究課題は、臨床的特徴や治療感受性、予後等の異なる個々の大腸癌を腫瘍微小環境の質特性に基づいて亜分類することで個別的な治療方針の最適化を目指すものである。網羅的遺伝子発現解析の応用による間質特異的・細胞特異的な解析と、免疫組織学的検証、癌細胞・間質細胞共培養などの手法を組み合わせることで、腫瘍微小機構を評価する独自の間質プロファイリング手法を確立し、複数の独立した大腸癌コホートに適用する。癌ゲノム・癌間質トランスクリプトームを応用した大腸癌治療の個別化に貢献するものと考えている。大腸癌手術摘出組織の解析に加え、間質特異的解析、フローサイトメトリーを用いた細胞特異的解析、シングルセル解析などに基づく各種高スループットデータを統合する。マイクロアレイやＲＮＡシークエンスデータを用いたうえで、さらに得られた間質特異的分子を免疫染色を用いて組織切片上で検出する。上述の種々の解析から大腸癌間質におけるTGFβシグナル活性化やミスマッチ修復欠損に着目し、背景にあるゲノム異常、免疫細胞浸潤、免疫療法抵抗性などの関連について検討を進めてきた。特異的治療や免疫療法とのコンビネーションが期待できるようなサブグループの同定につながった。
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