肝内胆管癌のゲノム進化様式と微小環境解析に基づく免疫療法に対する感受性予測の検討

2021 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 19K09220
• 研究機関: 九州大学
• 研究代表者: 江口 英利 九州大学, 大学病院, 特別教員 (90527756)
• 研究分担者: 鈴木 穣 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (40323646) ; 三森 功士 九州大学, 大学病院, 教授 (50322748)
• 研究期間 (年度): 2019-04-01 – 2022-03-31
• キーワード: CYT / サイトカイン / NK細胞 / RNA Seq / GZMA

研究実績の概要

肝内胆管癌における腫瘍免疫応答寛容を誘導する代謝産物及び遺伝子群を明らかにするため、肝内胆管癌切除症例10例に対して、各切除組織の癌部より3-9ヶ所、非癌部より1ヶ所の合計74検体を採取し、それぞれの検体に対してWhole Exome Sequence（①遺伝子変異解析、②Spectrum解析、③コピー数解析）、RNA sequence（①遺伝子発現解析、②fusion geneの解析）、プロテオーム解析、代謝産物の測定によるメタボローム解析による数理学的統合解析を行った。その結果、440種類の免疫関連細胞関連分子の胆管癌症例における発現プロファイルを得た。
具体的にその成果を述べる。予後(再発)に影響を与えるpathwayとして3つの遺伝子セットCytokine-cytokine receptor interaction 9、Natural killer cell mediated cytotoxicity、Chemokine signaling pathway以上の活性化を認めた。また。Cytolytic activityを示す分子は再発に比べて非再発例において過剰発現していた。具体的にはPRF1 (p value q value)は(0.040, 0.09)有意に高発現しており、GZMB(0.0164205,0.045782), IFNG(0.0165776, 0.045967)も同様であったが、GZMAは有意差を認めていない。しかし、新たな治療標的となる新規、免疫関連分子を同定してはいない。現在single cellデータのdeconvolutionを行っており、どの細胞由来の発現かも合わせて明らかにして投稿する。

研究成果

• [雑誌論文] Fanconi Anemia Complementation Group E, a DNA Repair-Related Gene, Is a Potential Marker of Poor Prognosis in Hepatocellular Carcinoma. (2022)
  • 著者名/発表者名: Takahashi J, Masuda T, Kitagawa A, Tobo T, Nakano Y, Abe T, Ando Y, Kosai K, Kobayashi Y, Matsumoto Y, Yoshizumi T, Mori M, Mimori K. Fanconi Anemia Complementation Group E, a DNA Repair-Related Gene, Is a Potential Marker of Poor Prognosis in Hepatocellular Carcinoma.
  • 雑誌名: Oncology. 巻: 100(2) ページ: 101-113
  • DOI: 10.1159/000520582.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] 高発現は肝細胞癌 （HCC）において予後不良マーカーである (2021)
  • 著者名/発表者名: 高橋純一、 増田隆明、北川彰洋、阿部正、斉藤秀幸、大里祐樹、安東由貴、中野貴文、小斎啓祐、小林雄太、倉光正太郎、藤井昌志、野田美和、鶴田祐介、松本佳大、大津 甫、黒田陽介、内田博喜、武石一樹、米村祐輔、森 正樹、三森功士
  • 学会等名: 第121回日本外科学会定期学術集会