| 研究課題/領域番号 |
19K10651
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| 研究機関 | 名古屋市立大学 |
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研究代表者 |
西山 毅 名古屋市立大学, 医薬学総合研究院(医学), 准教授 (40571518)
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| 研究分担者 |
鈴木 貞夫 名古屋市立大学, 医薬学総合研究院(医学), 教授 (20226509)
須藤 洋一 岩手医科大学, いわて東北メディカル・メガバンク機構, 特命助教 (50810561)
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| 研究期間 (年度) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| キーワード | メンデルランダム化 / 心理社会的アウトカム / 飲酒 |
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| 研究実績の概要 |
本研究では，Genome Cohort on Psychosocial Traits (GCOP)研究サンプルを用いる．GCOP研究では，約1,6000人を対象に，すべて妥当性の検証を受けた自記式質問紙を用いて心理社会的アウトカムおよび性別，年齢，婚姻状況，学歴，身体活動，食物摂取などを測定した．また，サンプリング時に行われた健診データも入手し，研究に利用可能である．GCOP研究では，すでに約千人分のサンプルに対しGenome-wide Association Study (GWAS)ジェノタイピングを施行済みである．
今年度は，メンデルランダム化研究に必要な，遺伝子型データを得る前段階として，約4千人分の血液検体からDNA抽出を行った．また，質問紙データのクリーニングについては，GCOP研究参加者のうち，約5000人分について完了した．また，操作変数となるSNPとして，飲酒については，ALDH2のrs671および ADH1Bのrs1229984を，コーヒー摂取については，日本人を対象にしたゲノムワイド関連研究（Sci Rep.2018;8(1):1493）を参考に選定することができた．
計画では，メンデルランダム化の操作変数に用いるSNPのジェノタイピングを行う予定であったが，その前段階となるDNA抽出とデータクリーニングに予想外に手間どり，ジェノタイピングを行うことができなかった．しかし，DNA抽出は予定人数分完了し，データクリーニングの目処もついたため，次年度には，SNPのジェノタイピングに着手可能である．
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
血液検体からのDNA抽出と，データクリーニングに思いの外時間を要したため，操作変数となるSNPのジェノタイピングを今年度は行うことができなかった．しかし，DNA抽出は目標サンプル分を完了でき，データクリーニングの完了もほぼ目処がついた．
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| 今後の研究の推進方策 |
今後は，残るデータクリーニングを終えた後，メンデルランダム化法の操作変数となるSNPのジェノタイピングを行う．
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| 次年度使用額が生じた理由 |
血液検体からのDNA抽出と，質問紙データのクリーニングに予想外にて間取り，最も資金を要するSNPのジェノタイピングを行うことができなかったため，次年度使用額が生じてしまった．しかし，DNA抽出とデータクリーニングの目処がついたため，次年度には予定どおりジェノタイピングを行うため，次年度使用額をすべて消化できる見込みである．
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