哺乳類ゲノムDNAは細胞核内において転写の活性なゲノム領域(A compartment)と不活性なゲノム領域 (B compartment)に区画されて収納されている。A/B compartmentは遺伝子発現、クロマチン修飾、複製タイミングなど核内の様々な現象と相関することから、正常なゲノム機能に重要だと推測される。しかしながら、A/B compartmentの形成機構や核内の現象におけるコンパートメント依存性の分子機構は未だ明らかではない。ヘテロクロマチン修飾であるH3K9me2は主にB compartmentに存在することから、Bコンパートメントの形成に関わる可能性がある。哺乳類にはG9a/GLP/SETDB1/SUV39H1/SUV39H2の5種類のH3K9メチル化酵素が存在する。本研究ではA/B compartmentとH3K9me2の相互作用を明らかにするため、各種H3K9メチル化酵素の欠損細胞における核内コンパートメントとエピゲノムをHiC-seqとChIP-seqにより解析した。その結果、H3K9meの消失がA/B compartmentを変化させたことから、ヘテロクロマチン修飾はA/B compartmentの形成に関与する因子の一つであることが明らかとなった。また、本研究の解析からH3K9me2はA compartmentにも存在し、compartmentごとに必要とされるメチル化酵素が異なることが判明した。従って、核内コンパートメントとクロマチン修飾の制御は互いに密接に相互作用することが示された。さらに、今回同定したcompartment依存的に働く分子の解析により、核内現象のコンパートメント依存性の分子機構の解明にも繋がると期待している。
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