本研究課題では、次世代型のDNAシークエンサーに対応した迅速なDNA多型解析システムの構築に向けて、ヒトのミトコンドリアゲノム、Y染色体、性別推定等に重要なマーカーや指標の開発に加え、微生物をはじめとするヒト以外の生物種を対象としたDNA多型解析技術も開発した。本課題で提案するY染色体ハプログループの推定法やヒト性別判定法については、数十塩基程の短い塩基配列をターゲットとすることで従来法に比べ迅速な判定が可能でありながら、シーケンスエラーやゲノムカバレッジに影響されにくいことから、今後のDNA多型解析の基盤技術として利用が期待される。
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