研究課題
ピロリ菌は胃がんの発がん細菌である.その発がん要因としてはIV型分泌装置を介してホスト細胞内に分泌されるCagAタンパクががんタンパクSHP2を活性化し 異常増殖シグナルを 生成すること等が分かっているが，非発がん型cagA株やcagA-株がいかにホスト細胞のゲノム変異・エピゲノム異常を引き起こし発がんに至 るのか，世界中で研究が進むものの詳細は明らかになっていない.ピロリ菌感染は慢性胃炎を経て萎縮性胃炎ないし腸上皮化生を誘発し，胃がん発がんリスクを 上昇させるというデメリットを持つが，胃酸を抑え逆流性食道炎を抑えことによって食道胃接合部がんを抑制するというメリットも持つ.また，除菌に用いる薬 剤による副作用，耐性菌の出現といったリスクもある.このため，ピロリ菌は除菌すべきでないという立場からの提言もあり，除菌すべきピロリ菌と除菌すべき でないピロリ菌を分類する必要性がある.そこで本研究では，発がんハイリスクピロリ菌の選択的除菌治療への基盤を創生する事を 目的として，ヒトゲノム データとピロリ菌ゲノム・DNAメチル化(メチローム)データを統合する申請者のオミックス解析技術を駆使して，ピロリ菌東アジア株110 株の層別化により除菌 すべきピロリ菌の特徴解明を行った.(A)これまでに得られていた全ゲノムデータを元に集団構造解析を行い,東アジアのピロリ菌亜集団hspEAsia内に,低発生率地域と高発生率地域の間の地理的分化を明らかにした．(B)これまでの解析でがん変異への関連が明らかになっているピロリ菌の持つ「ある制限酵素」について，去年度構築した大腸菌での発現系を用いた変異誘導実験を行い，全ゲノムを用いた変異解析を行った．
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すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 2件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (7件)
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