原爆被爆者に見られるクローン性造血の解析

2020 年度 実施状況報告書

• 研究課題/領域番号: 19K17832
• 研究機関: 長崎大学
• 研究代表者: 佐藤 信也 長崎大学, 病院(医学系), 助教 (70763754)
• 研究期間 (年度): 2019-04-01 – 2023-03-31
• キーワード: 原爆被爆者 / 遺伝子変異解析 / CHIP

研究実績の概要

近距離で被曝を受けた81名の臨床データを収集した。男女比は0.439、被爆時年齢の中央値は8歳（0-18）、被爆距離の中央値は0.9km（0.3-0.9）、48例で発熱、出血、下痢、脱毛などの急性期症状を認めた。
また、81名の近距離被爆者の末梢血から単核球をFicoll分離し、genomic DNAを抽出した（Qiagen：QIAamp DNA Blood Mini Kit）。抽出したgDNAのうち、1μgを用い、次世代シーケンサーによる全エクソンシーケンス（Illumina HiSeq 2500）を行い、全症例の解析が終了した。Average depthは、Mean 206x、Median 208x (111x-282x)であり、十分なdepthを確保できた。Depth of coverageは1症例を除き、100xratioが0.8以上であり、Average depthの結果と合わせてシーケンスの質は良好であった。非被爆者の骨髄異形成症候群に高頻度でみられるdriver変異（SF3B1、TET2、DNMT3A、IDH1/2、）は7例に認めた。コピー数異常については、81例中13例（16％）に認めた。
現在、得られた変異に対し、バリデーション（Illumina MiSeq）を行っている。また、コントロールサンプルとして、非被爆者20名についても末梢血の単核球からgDNAを抽出し、同様のシーケンス解析を行う予定である。

現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

近距離で被曝を受けた81名について次世代シーケンサーを用いた遺伝子変異解析およびコピー数解析が終了し、現在バリデーションを行っている。
また、コントロールサンプルとしての非被爆者20名の末梢血検体も収集済みであり、被爆者検体と同様の解析を開始している。

今後の研究の推進方策

2021年度は当初の計画通り、バリデーションによる遺伝子変異の決定を行う。また、非被爆者検体においても同様の遺伝子解析を行う予定である。