| 研究実績の概要 |
藤田医科大学病院で検出されたカルバペネマーゼ産生腸内細菌科細菌77株を研究対象とした。菌種はすべて全ゲノム解析を行い、BLASTで16srRNA領域の相同性を確認し、生物学的性状も確認して微生物の同定を行った。全ゲノム解析はIlluminaのMiseqを用いて行い、得られたFastqファイルはnullarborパイプラインによって、アセンブリを行った。
菌種内訳はEnterobacter cloacae complex48株、Klebsiella pnuemoniae 29株であった。感受性試験はディスク法で行い、全株カルバペネム耐性であることを確認した。
Enterobacter cloacae complex株の中で2株,ホスホマイシンディスク試験で阻止円内に発育する株を2株認めた。それぞれ感性株である親株とホスホマイシン耐性娘株における主要なホスホマイシン耐性遺伝子の比較を行った。GlpR, ptsI, cysA, cpxA, cpxR,fosA, MurAの配列は同一だった。ただ、UhpTとその周辺の欠損を認め、糖質利用機能解析でも輸送系の機能低下を示唆する所見を認めた。一方で耐性娘株のプラスミドクローニングでプラスミド内にホスホマイシン耐性に関与する要因の可能性が示唆された。プラスミド解析を進めたが、その要因の同定には至らなかった。
また、ホスホマイシンの感受性検査ではEnterobacter cloacae complex株は48株中22株が感性、Klebsiella pnuemoniae株は、24株中11株で感性だった。耐性株では全株でfosA遺伝子を認めた。感性株でもほとんどの株がfosA遺伝子を認めたが、リアルタイムPCRでFosAの発現量を比較したところ、耐性株で発現量が高い傾向を認めた。
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