研究課題
2015年から2018年に手術を実施した病理病期Ⅰ期の肺腺癌からレーザーキャプチャーマイクロダイセクションと次世代シークエンサーに耐えうる8例を選択した．これらに対してlepidic component （LC），papilary component（PC)，acinar component (AC) からレーザーキャプチャーマイクロダイセクションを行い，それぞれの組織を回収した．これらの組織からRNAを抽出して，RNAのqualityをチェックをすると，解析に耐えうる症例は６例であった．これらの６例で次世代シークエンサー（Ion Proton)によるtarget RNA sequenceを行い遺伝子発現を網羅的に解析した．発現遺伝子のうち，false discovery rete < 0.05として発現変動遺伝子を同定した．各組織別に特異的遺伝子発現を同定し，いくつかの遺伝子に着目した．着目した一部の遺伝子に対して免疫組織化学染色によるvalidation解析を行うため，新たに2015年から2018年までに手術が施行された，同じく病理病期I期の肺腺癌１３５例の肺切除検体を選択した．この１３５例のホルマリン固定検体からそれぞれ，新たに薄切切片を作成し，免疫組織化学染色を行った．免疫組織化学染色による，染色強度および範囲をそれぞれスコアリングして，着目した遺伝子発現の表現蛋白を書く組織別に算出した．
3: やや遅れている
2年間で終了予定であったが，解析に時間がかかりやや遅れている．
解析データを論文執筆し発表する予定である．
次年度は計画中の実験（免疫染色科学）に対して染色抗体やデータ解析・データ発表用PC，結果の執筆論文に対する投稿料などに対して使用予定
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すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件)
Lung Cancer
巻: 147 ページ: 56～63
10.1016/j.lungcan.2020.06.035
