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2022 年度 実施状況報告書

機械学習を用いた集中治療部における急性腎障害の発症予測と層別化

研究課題

研究課題/領域番号 19K18321
研究機関東京大学

研究代表者

佐藤 憲明  東京大学, 医科学研究所, 助教 (90838997)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2024-03-31
キーワード機械学習 / 急性腎障害 / ネットワーク解析
研究実績の概要

本研究は機械学習を用いて集中治療部における急性腎障害(AKI)の発症予測モデルの構築を行い、寄与因子の同定やその根拠可視化手法を開発することを目的としている。今年度は引き続きモデル作成とその精度検証を行った。具体的には機械学習における予測根拠可視化手法の不確実性表現に関する研究や、がん患者におけるAKI発症の個々人の予測根拠の臨床的な解釈についての研究を行った。さらに、今までに構築した計算リソースを利用してオミクスデータから遺伝子間のネットワーク解析を行う論文と腎障害を引き起こすウイルスの基礎的な解析論文を発表した。これらの成果は最終的に臨床データとオミクスデータの統合解析を通じて腎疾患の診療、病態解明の一助となることが期待される。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

急性腎障害の機械学習を用いた予測モデル構築とその根拠可視化手法の開発を進め、さらに腎疾患の発症や病態理解に資する研究発表を行ったため。

今後の研究の推進方策

機械学習を用いて大規模データベースで特定のアウトカムの予測を行う研究は既に多く報告されており、実際に予測モデルを用いた前向き研究による実臨床における有用性の確認や、オミクスデータといった他データの融合よる病態理解の研究に発展していく。

次年度使用額が生じた理由

今年度投稿予定であった論文の英文校正代金や、投稿中論文のArticle processing chargeを今年度予算に計上していたが、今年度中の執行が出来なかったため、次年度使用額が生じた。来年度の延長申請を行い、来年度中に投稿、受理を見込んでおり、当初の予定通り処理に係る代金に使用する予定である。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2022

すべて 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] CBNplot: Bayesian network plots for enrichment analysis2022

    • 著者名/発表者名
      Sato Noriaki、Tamada Yoshinori、Yu Guangchuang、Okuno Yasushi
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 38 ページ: 2959~2960

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btac175

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Everolimus reduces BK polyomavirus infection by suppressing its replication and spread of infection2022

    • 著者名/発表者名
      Sato Noriaki、Shiraki Atsuko、Mori Keita P.、Sakai Kaoru、Tan Long、Takemura Yoshinori、Okuno Yasushi、Tanabe Kazunari、Shiraki Kimiyasu
    • 雑誌名

      Antiviral Research

      巻: 208 ページ: 105456~105456

    • DOI

      10.1016/j.antiviral.2022.105456

    • 査読あり
  • [学会発表] Analysis of the alleviation of BK polyomavirus infection by everolimus in vitro2022

    • 著者名/発表者名
      Sato Noriaki、Shiraki Atsuko、Mori Keita P.、Sakai Kaoru、Tan Long、Takemura Yoshinori、Okuno Yasushi、Tanabe Kazunari、Shiraki Kimiyasu
    • 学会等名
      Transplantation Science Symposium Asian Regional Meeting 2022
    • 国際学会
  • [学会発表] wcGeneSummary: Text Mining And Annotating Gene Cluster2022

    • 著者名/発表者名
      Sato Noriaki
    • 学会等名
      Bioconductor conference 2022
    • 国際学会

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公開日: 2023-12-25  

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