研究成果の概要 |
ハンナ型間質性膀胱炎(HIC)148例、control 896例からなるコホートより509,305バリアントのジェノタイプデータを得て、日本人集団のリファレンスパネルを用いた遺伝型imputationを行い、常染色体上の7,994,849バリアント、X染色体上の219,983バリアントを得た。HLA遺伝子のバリアントについてはHLA imputationを行い2287バリアントを得た。 MHC領域のファインマッピングを行い、有意水準を満たすバリアントとしてrs1794275を同定し連鎖不平衡関係にあるHLA-DQB1遺伝子の75番目アミノ酸残基も強い関連を示した(P = 1.4×10-6)。
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