| 研究課題/領域番号 |
19K18622
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| 研究機関 | 順天堂大学 |
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研究代表者 |
河野 春奈 順天堂大学, 医学部, 特任准教授 (90445528)
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| 研究期間 (年度) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| キーワード | ADPKD / TSC / 遺伝子解析 / パネル遺伝子検査 / 隣接遺伝子症候群 |
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| 研究実績の概要 |
本研究において、遺伝性疾患である常染色体優性多発性嚢胞腎（ADPKD）と結節性硬化症（TSC）について、その生殖細胞系列変異の遺伝子解析を行い、その病態や治療薬効果との関連を検討した。パネル遺伝子検査を行ったのち、コピー数多型解析として、Multiplex ligation- dependent probe assay（MLPA）法で遺伝子のExon単位でのコピー数変化を検出した。ターゲットリシーケンスでカバーできないExon領域は、遺伝子特異的Long PCRを行い、これを鋳型としたダイレクトシーケンスを行った。目標症例数500例に対し、2020年度に約400例の研究参加同意を取得し、うち約300例の解析が終了した。
臨床診断でADPKDと診断されていたが、原因遺伝子が異なる症例がみとめられ、SEC63、OFD1、GANAB遺伝子変異であった。またPKD変異の症例において、PKD2変異が全体の26.7％を占め、約15％とするこれまでの報告に比べやや割合が高かった。PKD1Exon欠失（TSCとの隣接遺伝子症候群を含む）、PKD2Exon欠失も合わせて4.7％にのぼり、従来の遺伝子診断で診断がつかなかったケースは、いずれかのExon欠失である可能性が示唆された。また、本研究においては同一家系内症例も含まれており、すべての同一家系内での遺伝子変異部位は一致していた。TSC、ADPKDの隣接遺伝子症候群は4例にみとめられ、すべての症例でTSC2,PKD1にまたがる欠失を認めた。隣接遺伝子症候群の場合はADPKDの病態が優位で、腎機能障害が早期に出現することが知られているが、いずれの症例もTSCの症状が非常に優位であった。TSCは腎嚢胞を伴うことがあることからも、TSCとしか診断されていない隣接遺伝子症候群の患者がいる可能性が考えられた。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
2020年度は新型コロナウイルス感染症が流行したことから、患者の受診控えがおこり、当初予定していたペースでの患者同意取得が行えず、そのためにやや遅延しているが、検体採取後の解析については当初の予定通り進展している。
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| 今後の研究の推進方策 |
新型コロナウイルス感染症流行に伴い患者のリクルートがやや遅れたが、すでに目標症例数達成のめどがついており、遺伝子解析も順調に進んでいる。今後は得られた遺伝子結果データベースと臨床情報を照らし合わせ、様々な解析研究を行う。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
2020年度は新型コロナウイルス感染症が流行したことに伴い、研究対象患者の受診控えがおこった影響で、当初予定していた検体採取が平均して約半年程度遅くなったことから、次年度使用額が生じています。次年度で予定症例数の検体取得、解析終了のめどはたっています。
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