• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2019 年度 実施状況報告書

侵襲性歯周炎の網羅的ゲノム解析-エクソームシークエンスとNOD2変異の機能解明-

研究課題

研究課題/領域番号 19K19019
研究機関東京医科歯科大学

研究代表者

須藤 毅顕  東京医科歯科大学, 歯学部附属病院, 医員 (10821168)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2021-03-31
キーワード侵襲性歯周炎 / NOD2 / エクソーム解析 / バイオインフォマティクス
研究実績の概要

侵襲性歯周炎は、早期に発症し急速な歯槽骨破壊を引き起こす特殊な歯周炎であり口腔内のQOLを著しく損なう疾患である。家族内集積性という特徴から遺伝要因の関与が示唆され、これまで多くの遺伝子研究が報告されているが、未だ不明な点が多い。申請者は、侵襲性歯周炎患者を含む2家系のゲノムDNAを用いたエクソーム解析を実施し、NOD2遺伝子内に新規遺伝子変異を同定した。自然免疫において重要な役割を担うNOD2は、グラム陰性菌の構成要素であるMDPを認識し、NF-κBを活性化することが知られている。しかしながら、申請者の同定したNOD2の新規遺伝子変異がNOD2タンパクおよび侵襲性歯周炎に及ぼす影響は分かっていない。本研究では、新規同定したNOD2 遺伝子変異がもたらす生体内での機能異常をin vitroな研究により検討し、疾患発症の分子メカニズムの解明を目的とする。また、NOD2遺伝子のみで遺伝要因の全てを説明できないため、新たな家系内罹患者の遺伝子解析による新たな疾患発症に寄与する遺伝子変異の同定を行い、遺伝学的診断のための新規バイオマーカーの樹立を目指す。
本年度の研究においては、東京医科歯科大学歯周病外来受診歴のある患者のカルテを網羅的に検索し、侵襲性歯周炎で治療中の患者を把握した。また血縁者に侵襲性歯周炎の発症者がいないか問診し、姉妹が発症している2サンプル、および発症している娘と未発症の父親の2サンプルについて、同意取得の後、同大学バイオリソースセンターを活用した検体採取およびゲノムDNAの抽出を行った。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

当初の予想より、侵襲性歯周炎罹患者の家系例が少なかったため、探索に期間を要した。またアメリカ歯周病学会とヨーロッパ歯周病学会で歯周炎の分類の再定義が行われたため、侵襲性歯周炎患者のリクルートを行う診断基準、パイプラインの構築も再検討を行った。トルコ人由来の侵襲性歯周炎サンプルを用いてNOD2領域のディープシークエンス解析も実施予定だが、共同研究先が倫理審査委員会の承認ならびにゲノム抽出を行っている段階である。

今後の研究の推進方策

まずエクソーム解析は現在DNA抽出を行った4サンプルで実施し、NOD2領域の変異の有無ならびに新規遺伝子変異の探索を行う。NOD2領域のディープシークエンス解析は、サンプルが届き次第解析を実施する予定である。また再構築したパイプラインに沿って、新規侵襲性歯周炎罹患者の探索、サンプリングと、コントロール群としての慢性歯周炎患者のサンプリングも進めていく予定である。

次年度使用額が生じた理由

研究費は主にシークエンスにかかる試薬に計上予定だが、当初よりもサンプリングに時間を要したため、次年度に持ち越しとなった。次年度に家族例のエクソーム解析ならびにトルコ人由来侵襲性歯周炎のディープシークエンス解析の試薬および解析費用として使用予定である。

  • 研究成果

    (2件)

すべて 2019 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件)

  • [国際共同研究] Abant Izzet Baysal University/Baskent University(トルコ)

    • 国名
      トルコ
    • 外国機関名
      Abant Izzet Baysal University/Baskent University
  • [雑誌論文] Genome-wide analysis of dental caries and periodontitis combining clinical and self-reported data2019

    • 著者名/発表者名
      Shungin D, Haworth S, Divaris K,et al.
    • 雑誌名

      NATURE COMMUNICATIONS

      巻: 10 (1) ページ: 2773

    • DOI

      10.1038/s41467-019-10630-1

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著

URL: 

公開日: 2021-01-27  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi