口腔癌における転写増強機序tandem duplicatorの分布の全ゲノム解析

2020 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 19K19153
• 研究種目: 若手研究
• 配分区分: 基金
• 審査区分: 小区分57060:外科系歯学関連
• 研究機関: 千葉大学
• 研究代表者: 宮本 勲 千葉大学, 医学部附属病院, 医員 (00741836)
• 研究期間 (年度): 2019-04-01 – 2021-03-31
• キーワード: 次世代シーケンス / tandem dupulicator / CNV

研究成果の概要

本研究では、研究室保有の口腔扁平上皮癌細胞株に対して放射線照射を行い、細胞生存曲線を作製し、放射線耐性株および感受性株を同定した。同定した細胞株に対して次世代シークエンスを用いて全ゲノム的に解析を行った。解析結果により放射線治療前後でコピー数多型（CNV）の変異の生じた領域を検索し、CNVの傾向によってそれぞれの領域で特異的に発現している遺伝子を抽出した。これらの遺伝子は放射線耐性や感受性に関与していると考えられ、今後さらなる研究対象や標的因子となりうる可能性がある。

自由記述の分野

分子生物学

研究成果の学術的意義や社会的意義

口腔癌発生過程においては、多くの遺伝子による系統的な異常が積み重なることが原因であると考えられている。近年、mutationなどの単純な構造異常ばかりではなく、遺伝子配列の繰り返し構造であるtandem duplicator(TD)の全ゲノム上における分布状態やコピー数多型（CNV）が系統的意義を有することが提唱されている。これらは非常に強力な遺伝子発現システムであり、本研究では全ゲノムワイドな解析によりTDやCNVがどのような領域で起きているかを検討し、その分布状況を明らかにし、口腔癌発生や治療抵抗性獲得にどのように関与しているかを検討するという学術的意義が考えられる。