人工核酸LNAを用いた日本人集団における高感度メチル化解析と年齢推定への応用

2021 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 19K19477
• 研究機関: 旭川医科大学
• 研究代表者: 磯崎 翔太郎 旭川医科大学, 大学病院, 医員 (60834504)
• 研究期間 (年度): 2019-04-01 – 2022-03-31
• キーワード: メチル化

研究実績の概要

日本人集団70名から抽出したDNAに対し、7領域(PTPN7, SST, CNGA3, KLF14, TSSK6, TBR1, and SLC12A5)のCpG配列のメチル化率を一塩基伸長法により測定し、重回帰分析を用いることで平均絶対偏差4.88歳の法医学的年齢推定法を確立した。本法におけるマルチプレックスPCRの段階において、各Primerの5'末端側にLNAを2塩基導入したPrimerを設計し、0%,50%,100%のメチル化率のstandard DNA 10ng に対してメチル化率測定を行い、LNA未導入のPrimerを用いた場合と比較した。その結果、LNA導入のprimerを使用した場合、7領域中6領域でキャピラリー電気泳動時の相対蛍光単位の増高が認められた。2021年度に本研究成果を日本DNA多型学会第30回学術集会で発表した。

研究成果

• [雑誌論文] Soluble thrombomodulin ameliorates aberrant hemostasis after rewarming in a rat accidental hypothermia model (2022)
  • 著者名/発表者名: Takauji Shuhei、Tanaka Hiroki、Hayakawa Mineji、Horioka Kie、Isozaki Shotaro、Konishi Hiroaki
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 587 ページ: 1～8
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2021.11.086
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Hypoxia-induced nuclear translocation of β-catenin in the healing process of frostbite (2022)
  • 著者名/発表者名: Isozaki Shotaro、Tanaka Hiroki、Horioka Kie、Konishi Hiroaki、Kashima Shin、Takauji Shuhei、Fujiya Mikihiro、Druid Henrik
  • 雑誌名: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Basis of Disease 巻: 1868 ページ: 166385～166385
  • DOI: 10.1016/j.bbadis.2022.166385
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Probiotic Aspergillus oryzae produces anti-tumor mediator and exerts anti-tumor effects in pancreatic cancer through the p38 MAPK signaling pathway (2021)
  • 著者名/発表者名: Konishi Hiroaki、Isozaki Shotaro、Kashima Shin、Moriichi Kentaro、Ichikawa Satoshi、Yamamoto Kazuki、Yamamura Chikage、Ando Katsuyoshi、Ueno Nobuhiro、Akutsu Hiroaki、Ogawa Naoki、Fujiya Mikihiro
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 11 ページ: 11070
  • DOI: 10.1038/s41598-021-90707-4
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Treatment of hepatocellular carcinoma with autologous platelets encapsulating sorafenib or lenvatinib: A novel therapy exploiting tumor‐platelet interactions (2021)
  • 著者名/発表者名: Tanaka Hiroki、Horioka Kie、Hasebe Takumu、Sawada Koji、Nakajima Shunsuke、Konishi Hiroaki、Isozaki Shotaro、Goto Masanori、Fujii Yumiko、Kamikokura Yuki、Ogawa Katsuhiro、Nishikawa Yuji
  • 雑誌名: International Journal of Cancer 巻: 150 ページ: 1640～1653
  • DOI: 10.1002/ijc.33915
  • 査読あり / 国際共著
• [学会発表] 人工核酸導入Primerを用いた高感度メチル化解析と法医学的年齢推定 (2021)
  • 著者名/発表者名: 磯崎翔太郎
  • 学会等名: 日本DNA多型学会第30回学術集会
• [学会発表] The assessment of cutaneous epithelium hypoxia in the murine frostbite model (2021)
  • 著者名/発表者名: Shotaro Isozaki, Hiroki Tanaka, Kie Horioka, Hiroaki Konishi, Shin Kashima, Henrik Druid
  • 学会等名: 第105次日本法医学会学術全国集会