遺伝子発現の個人差と表現型の関連を調べる手法の開発を目指した。その中で、大規模エピゲノムデータに基づき、ゲノム配列の個人差が転写因子結合に与える影響の予測に成功した。また、遺伝子発現変動に生体内環境が与える影響を調べるため、臓器由来の1細胞空間トランスクリプトームデータにおいて各細胞の遺伝子発現変動に周囲の細胞が与える影響を評価した。さらに、遺伝子発現の個人差と表現型の関連について知見を得るため、大規模コホートのがん組織由来バルクRNA-seqデータと少人数のがん組織由来1細胞RNA-seqデータから、発現量の多寡が生存時間に影響を与える細胞間相互作用を抽出し、予後との関連を明らかにした。
|