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本課題では、RNAを脱アミノ反応により塩基変換するRNAを、in vitro選別法により作成することを目指す。これまでに、in vitro選別法の実験手法を習得し機能性RNAを精製する技術の取得に努めた。また、本課題の戦略が実際に成功することを確認するため、同様のin vitro選別法により、特定タンパク質の特定ドメインを認識し、そこの結合できるRNAフラグメントの作製を試みた。結合標的としては、概日リズム形成に深くかかわることが知られているPeriodのPASドメインを選定し、このドメインの働きを時間的・空間的に阻害する遺伝学手法の開発を目指した。これまでに、特定タンパク質の特定ドメインのみを生体内で可逆的に阻害する手法は存在しておらず、本課題で行っている新奇RNA精製は、研究代表者の実験手技習得という目的のみならず、それ自体として非常に価値が高いと言える。
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